RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218376.1

Sfta3-ps-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sfta3-ps, Length 2,128 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Znf330Q922H9 316 aa17.3■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Slc4a3P16283 1227 aa17.3■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 RgmbQ7TQ33 436 aa17.3■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa17.3■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa17.3■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 FocadA2AKG8 1798 aa17.3■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Rtl5Q5DTT4 599 aa17.29■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Sos1Q62245 1319 aa17.29■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Simc1E9Q6E9 1354 aa17.29■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Nsd3Q6P2L6 1439 aa17.28■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 HdgfP51859 237 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Pak3Q61036 559 aa17.28■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa17.27■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 ZgpatQ8VDM1 511 aa17.27■□□□□ 0.36
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Irx6Q9ER75 438 aa17.26■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Slit1Q80TR4 1531 aa17.26■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Fam50bQ9WTJ8 334 aa17.26■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Nutm1Q8BHP2 1126 aa17.25■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 ThemisQ8BGW0 636 aa17.24■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Aox2Q5SGK3 1345 aa17.24■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Hspa1lP16627 641 aa17.23■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Nkx2-3P97334 362 aa17.23■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa17.23■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Myo5bP21271 1818 aa17.23■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Tnnt1O88346 262 aa17.23■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Znf526Q8BI66 675 aa17.23■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Tnks1bp1P58871 1720 aa17.22■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Zpr1Q62384 459 aa17.22■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Qtrt2B8ZXI1 415 aa17.21■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Tom1O88746 492 aa17.21■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Aplp1Q03157 653 aa17.21■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Q3UPC7 1272 aa17.21■□□□□ 0.35
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Znf521Q6KAS7 1311 aa17.21■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Q3TQI7 289 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa17.2■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Plekhd1B2RPU2 505 aa17.2■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa17.2■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Pdzd9Q9D9M4 266 aa17.2■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa17.19■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Abcc12Q80WJ6 1366 aa17.19■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Ccdc155Q80VJ8 648 aa17.18■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa17.18■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Slx1bQ8BX32 270 aa17.18■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Supt16hQ920B9 1047 aa17.18■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Chpf2Q3UU43 768 aa17.18■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Btbd11Q6GQW0 1109 aa17.17■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa17.17■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa17.17■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Chl1P70232 1209 aa17.17■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Aifm3Q3TY86 605 aa17.17■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Phkg2Q9DB30 406 aa17.17■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Igsf1Q7TQA1 1317 aa17.16■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Dlg5E9Q9R9 1921 aa17.16■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 PrkcshO08795 521 aa17.16■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Anp32aO35381 247 aa17.16■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa17.16■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Chmp7Q8R1T1 451 aa17.16■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Speer4bQ9D9F7 267 aa17.16■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Pard3Q99NH2 1333 aa17.16■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Ric3Q8BPM6 367 aa17.15■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Tns2Q8CGB6 1400 aa17.15■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Armcx1Q9CX83 456 aa17.14■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Akap11E9Q777 1895 aa17.13■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa17.12■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Sv2bQ8BG39 683 aa17.12■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Rlbp1Q9Z275 317 aa17.12■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Fam83gQ5SWY7 812 aa17.12■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Asic4Q7TNS7 539 aa17.12■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Atf5O70191 283 aa17.11■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Ggt6Q6PDE7 497 aa17.11■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa17.11■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Gm7361D3Z6R1 267 aa17.11■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa17.11■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Gm1979E9QAN3 267 aa17.11■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Gm5862K7N5V5 267 aa17.11■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Gm10220K7N660 267 aa17.11■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Bcl2l13P59017 434 aa17.1■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 MvpQ9EQK5 861 aa17.1■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Col1a2Q01149 1372 aa17.1■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Fkbp4P30416 458 aa17.09■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 B4galnt3Q6L8S8 986 aa17.09■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.6 ms