RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ApobrQ8VBT6 942 aa26.37■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa26.36■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm7361D3Z6R1 267 aa26.36■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa26.36■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm1979E9QAN3 267 aa26.36■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm5862K7N5V5 267 aa26.36■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm10220K7N660 267 aa26.36■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pim2Q62070 370 aa26.36■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Amotl1Q9D4H4 968 aa26.36■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Phkg2Q9DB30 406 aa26.36■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa26.35■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa26.34■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccnl1Q52KE7 532 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Q7TT23 1179 aa26.34■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Asic4Q7TNS7 539 aa26.33■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc5a1Q8C3K6 665 aa26.33■■□□□ 1.81
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pdzd9Q9D9M4 266 aa26.32■■□□□ 1.8
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Aox2Q5SGK3 1345 aa26.32■■□□□ 1.8
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Q8BT18 775 aa26.31■■□□□ 1.8
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa26.31■■□□□ 1.8
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ciz1Q8VEH2 845 aa26.3■■□□□ 1.8
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Stk31Q99MW1 1018 aa26.3■■□□□ 1.8
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Crb1Q8VHS2 1405 aa26.3■■□□□ 1.8
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ssfa2Q922B9 1252 aa26.3■■□□□ 1.8
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kiaa0319lQ8K135 1048 aa26.29■■□□□ 1.8
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Klc3Q91W40 508 aa26.29■■□□□ 1.8
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ankrd13dQ6PD24 605 aa26.27■■□□□ 1.8
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa26.27■■□□□ 1.8
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Chmp7Q8R1T1 451 aa26.27■■□□□ 1.8
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trpm3Q5F4S9 1721 aa26.26■■□□□ 1.79
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ints5Q8CHT3 1018 aa26.24■■□□□ 1.79
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cabp2Q9JLK4 216 aa26.23■■□□□ 1.79
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Exoc6Q8R313 802 aa26.22■■□□□ 1.79
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa26.21■■□□□ 1.79
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Snap23O09044 210 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nkx2-3P97334 362 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fchsd2Q3USJ8 740 aa26.2■■□□□ 1.78
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atf7ipQ7TT18 1306 aa26.18■■□□□ 1.78
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Q4VA45 678 aa26.17■■□□□ 1.78
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa26.17■■□□□ 1.78
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa26.16■■□□□ 1.78
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Iqcf3Q9D498 203 aa26.16■■□□□ 1.78
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam198bQ3UPI1 517 aa26.15■■□□□ 1.78
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atg3Q9CPX6 314 aa26.14■■□□□ 1.78
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc155Q80VJ8 648 aa26.13■■□□□ 1.77
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kif23E9Q5G3 953 aa26.12■■□□□ 1.77
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Apaf1O88879 1249 aa26.12■■□□□ 1.77
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bicdl1A0JNT9 577 aa26.11■■□□□ 1.77
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa26.11■■□□□ 1.77
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Abcc12Q80WJ6 1366 aa26.1■■□□□ 1.77
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Akt1s1Q9D1F4 257 aa26.1■■□□□ 1.77
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Igsf1Q7TQA1 1317 aa26.09■■□□□ 1.77
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PsdQ5DTT2 1024 aa26.09■■□□□ 1.77
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Jmjd4Q8BFT6 427 aa26.08■■□□□ 1.77
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cap2Q9CYT6 476 aa26.08■■□□□ 1.77
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dcaf5Q80T85 946 aa26.06■■□□□ 1.76
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sos1Q62245 1319 aa26.04■■□□□ 1.76
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf541Q0GGX2 1363 aa26.04■■□□□ 1.76
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AceP09470 1312 aa26.04■■□□□ 1.76
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zscan21Q07231 555 aa26.02■■□□□ 1.76
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Golga2Q921M4 999 aa26.01■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AtrnQ9WU60 1428 aa26.01■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Myo5bP21271 1818 aa26■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa26■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MeiocA2AG06 965 aa26■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Efcab2Q9CQ46 164 aa26■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm13023A2A8N2 498 aa25.99■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gpr150Q8BL07 427 aa25.99■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Esx1O88933 382 aa25.98■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Smarcc1P97496 1104 aa25.98■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mrs2Q5NCE8 434 aa25.98■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ric1Q69ZJ7 1422 aa25.98■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cavin4A2AMM0 362 aa25.97■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Miga2Q8BK03 593 aa25.97■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trpc5Q9QX29 975 aa25.97■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Kndc1Q0KK55 1742 aa25.95■■□□□ 1.75
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 En2P09066 324 aa25.95■■□□□ 1.74
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Btbd11Q6GQW0 1109 aa25.94■■□□□ 1.74
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sall2Q9QX96 1004 aa25.93■■□□□ 1.74
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prim1P20664 417 aa25.92■■□□□ 1.74
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Jdp2P97875 163 aa25.92■■□□□ 1.74
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp19Q3UJD6 1360 aa25.92■■□□□ 1.74
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nav1Q8CH77 1875 aa25.92■■□□□ 1.74
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Emilin1Q99K41 1017 aa25.91■■□□□ 1.74
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 C4bP01029 1738 aa25.91■■□□□ 1.74
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ggnbp2Q5SV77 696 aa25.91■■□□□ 1.74
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PigbQ9JJQ0 542 aa25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.8 ms