RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088311.5

Gbx1-201, Transcript of Homeobox protein GBX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gbx1, Length 3,475 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
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Gbx1-201ENSMUST00000088311 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa20.33■□□□□ 0.85
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Gbx1-201ENSMUST00000088311 Trim30aP15533 496 aa20.32■□□□□ 0.84
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Cavin4A2AMM0 362 aa20.32■□□□□ 0.84
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Gbx1-201ENSMUST00000088311 Iqsec2Q5DU25 1478 aa20.31■□□□□ 0.84
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Gbx1-201ENSMUST00000088311 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa20.29■□□□□ 0.84
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Gbx1-201ENSMUST00000088311 Inpp5bQ8K337 993 aa20.29■□□□□ 0.84
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Slc12a5Q91V14 1138 aa20.29■□□□□ 0.84
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Gbx1-201ENSMUST00000088311 Usp16Q99LG0 825 aa20.28■□□□□ 0.84
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Gbx1-201ENSMUST00000088311 Fndc1E9Q043 1732 aa20.27■□□□□ 0.84
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa20.27■□□□□ 0.84
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa20.27■□□□□ 0.84
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Cfap65Q3V0B4 1847 aa20.27■□□□□ 0.84
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Irx2P81066 474 aa20.27■□□□□ 0.84
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Mx2Q9WVP9 655 aa20.27■□□□□ 0.84
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Gbx1-201ENSMUST00000088311 Swt1Q9DBQ9 907 aa20.25■□□□□ 0.83
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Gli2Q0VGT2 1544 aa20.25■□□□□ 0.83
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Card6E9PWH2 1175 aa20.25■□□□□ 0.83
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Gbx1-201ENSMUST00000088311 Rims1Q99NE5 1463 aa20.24■□□□□ 0.83
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Prex1Q69ZK0 1650 aa20.24■□□□□ 0.83
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Gm45015A0A140LII9 184 aa20.24■□□□□ 0.83
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Gm18336A0A140LIU8 765 aa20.24■□□□□ 0.83
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Gm156Q58A37 223 aa20.24■□□□□ 0.83
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Tpd52l1O54818 204 aa20.23■□□□□ 0.83
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Mmel1Q9JLI3 765 aa20.23■□□□□ 0.83
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa20.23■□□□□ 0.83
Gbx1-201ENSMUST00000088311 EvcP57680 1005 aa20.23■□□□□ 0.83
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Gbx1-201ENSMUST00000088311 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa20.23■□□□□ 0.83
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Gbx1-201ENSMUST00000088311 F2rP30558 430 aa20.21■□□□□ 0.83
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Gbx1-201ENSMUST00000088311 Ccdc96Q9CR92 584 aa20.21■□□□□ 0.83
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Tomm22Q9CPQ3 142 aa20.21■□□□□ 0.83
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Gbx1-201ENSMUST00000088311 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa20.2■□□□□ 0.82
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Hmox1P14901 289 aa20.2■□□□□ 0.82
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Cabp2Q9JLK4 216 aa20.2■□□□□ 0.82
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Kcnf1Q7TSH7 493 aa20.19■□□□□ 0.82
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Erc2Q6PH08 957 aa20.19■□□□□ 0.82
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Naip7Q9JIB3 1402 aa20.19■□□□□ 0.82
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Jakmip1Q8BVL9 626 aa20.19■□□□□ 0.82
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Ssr1Q9CY50 286 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Snx13Q6PHS6 957 aa20.18■□□□□ 0.82
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa20.18■□□□□ 0.82
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Psmd1Q3TXS7 953 aa20.18■□□□□ 0.82
Gbx1-201ENSMUST00000088311 St18Q80TY4 1045 aa20.18■□□□□ 0.82
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa20.18■□□□□ 0.82
Gbx1-201ENSMUST00000088311 Abca8aQ8K442 1620 aa20.17■□□□□ 0.82
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