RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tns2Q8CGB6 1400 aa23.49■■□□□ 1.35
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Abcc12Q80WJ6 1366 aa23.49■■□□□ 1.35
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Akap11E9Q777 1895 aa23.49■■□□□ 1.35
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Snap23O09044 210 aa23.48■■□□□ 1.35
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pak3Q61036 559 aa23.48■■□□□ 1.35
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Aox2Q5SGK3 1345 aa23.48■■□□□ 1.35
Cbx1-201ENSMUST00000018810 ThemisQ8BGW0 636 aa23.47■■□□□ 1.35
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zpr1Q62384 459 aa23.47■■□□□ 1.35
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ggnbp2Q5SV77 696 aa23.43■■□□□ 1.34
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa23.43■■□□□ 1.34
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Usp16Q99LG0 825 aa23.43■■□□□ 1.34
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Trim26Q99PN3 545 aa23.43■■□□□ 1.34
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fam50bQ9WTJ8 334 aa23.4■■□□□ 1.34
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Dlg5E9Q9R9 1921 aa23.39■■□□□ 1.34
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ggt6Q6PDE7 497 aa23.39■■□□□ 1.33
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pdzd9Q9D9M4 266 aa23.37■■□□□ 1.33
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Igsf1Q7TQA1 1317 aa23.37■■□□□ 1.33
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PappaQ8R4K8 1624 aa23.36■■□□□ 1.33
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vamp4O70480 141 aa23.36■■□□□ 1.33
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fbln2P37889 1221 aa23.36■■□□□ 1.33
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa23.34■■□□□ 1.33
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Chmp7Q8R1T1 451 aa23.34■■□□□ 1.33
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mast2Q60592 1734 aa23.34■■□□□ 1.33
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nsd3Q6P2L6 1439 aa23.33■■□□□ 1.33
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Speer4bQ9D9F7 267 aa23.33■■□□□ 1.33
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa23.31■■□□□ 1.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pibf1E9Q6K3 756 aa23.31■■□□□ 1.32
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cntnap1O54991 1385 aa23.3■■□□□ 1.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nwd2Q6P5U7 1742 aa23.3■■□□□ 1.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa23.29■■□□□ 1.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nkx2-3P97334 362 aa23.29■■□□□ 1.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Emilin2Q8K482 1074 aa23.29■■□□□ 1.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mst1rQ62190 1378 aa23.29■■□□□ 1.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa23.29■■□□□ 1.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cypt2Q6P924 180 aa23.28■■□□□ 1.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Asic4Q7TNS7 539 aa23.28■■□□□ 1.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sema6bO54951 886 aa23.26■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Btbd11Q6GQW0 1109 aa23.26■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kcnh4A2A5F7 1018 aa23.26■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc129Q14B48 1034 aa23.26■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 BcorQ8CGN4 1759 aa23.25■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa23.25■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm7361D3Z6R1 267 aa23.25■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa23.25■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm1979E9QAN3 267 aa23.25■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm5862K7N5V5 267 aa23.25■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm10220K7N660 267 aa23.25■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pm20d1Q8C165 503 aa23.25■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pank1Q8K4K6 548 aa23.25■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Col1a2Q01149 1372 aa23.25■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc5a1Q8C3K6 665 aa23.24■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Psrc1Q9D0P7 329 aa23.24■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tjp1P39447 1745 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atf5O70191 283 aa23.24■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Q3TQI7 289 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ginm1Q91WR6 327 aa23.24■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc155Q80VJ8 648 aa23.23■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Chpf2Q3UU43 768 aa23.22■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmco5bQ80X59 307 aa23.22■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa23.22■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa23.22■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Chl1P70232 1209 aa23.21■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 MypopQ8R4U1 393 aa23.21■■□□□ 1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sik1Q60670 779 aa23.2■■□□□ 1.3
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