RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589528.1

ACTN4-211, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ACTN4, Length 441 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-211ENST00000589528 ZDHHC12Q96GR4 267 aa15.02■□□□□ -0
ACTN4-211ENST00000589528 SPATA16Q9BXB7 569 aa15.02■□□□□ -0
ACTN4-211ENST00000589528 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
ACTN4-211ENST00000589528 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.02■□□□□ -0
ACTN4-211ENST00000589528 PDE7BQ9NP56 450 aa15.02■□□□□ -0
ACTN4-211ENST00000589528 ARFGAP3Q9NP61 516 aa15.02■□□□□ -0
ACTN4-211ENST00000589528 MAP10Q9P2G4 905 aa15.02■□□□□ -0
ACTN4-211ENST00000589528 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
ACTN4-211ENST00000589528 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
ACTN4-211ENST00000589528 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa15.02■□□□□ -0
ACTN4-211ENST00000589528 SHANK1Q9Y566 2161 aa15.02□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 MED13Q9UHV7 2174 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 C21orf140B9A014 251 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 RPL26P61254 145 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SEMA5AQ13591 1074 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF569Q5MCW4 686 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 IRGCQ6NXR0 463 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 FAM92BQ6ZTR7 304 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 AOPEPQ8N6M6 819 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 CT55Q8WUE5 264 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SLC25A23Q9BV35 468 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ACTL8Q9H568 366 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 LHX9Q9NQ69 397 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ACSS2Q9NR19 701 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.014e-7■■■□□ 15.8
ACTN4-211ENST00000589528 OGFRQ9NZT2 677 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa15.01□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 A1L4Q6 167 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 RECKO95980 971 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 PDGFAP04085 211 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 MYBL1P10243 752 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 RARAP10276 462 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 FGF5P12034 268 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 TCF4P15884 667 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SSR1P43307 286 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 CAPZBP47756 277 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 CLCNKAP51800 687 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 PDE1BQ01064 536 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 MYL5Q02045 173 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ASIC2Q16515 512 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 PRSS42Q7Z5A4 293 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 TEKT4Q8WW24 435 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 THAP4Q8WY91 577 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 CXorf40BQ96DE9 158 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 WDR24Q96S15 920 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 TRIM55Q9BYV6 548 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 HAUS4Q9H6D7 363 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 PCDH18Q9HCL0 1135 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 POT1Q9NUX5 634 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 RARRES3Q9UL19 164 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 MYO6Q9UM54 1294 aa15□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 RGSL1A5PLK6 1076 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 LRRC53A6NM62 1247 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 KMOO15229 486 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 MATN3O15232 486 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 MFSD11O43934 449 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 GPR89BP0CG08 455 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 GZMAP12544 262 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SLC19A1P41440 591 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ARL4DP49703 201 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 RPS15P62841 145 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 TUBB3Q13509 450 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 NADK2Q4G0N4 442 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ALS2CLQ60I27 953 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 RSC1A1Q92681 617 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 LYSMD1Q96S90 227 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SYT11Q9BT88 431 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 CASS4Q9NQ75 786 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 AMACRQ9UHK6 382 aa14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SEMA7AO75326 666 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 PRLP01236 227 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 SLC4A1P02730 911 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms