RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 RCOR1Q9UKL0 485 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 CFAP45Q9UL16 551 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 NEU3Q9UQ49 428 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 HPSEQ9Y251 543 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 AKAP9Q99996 3911 aa7.07□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 C19orf84I3L1E1 186 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 MEN1O00255 615 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 CCL21O00585 134 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 KCNN4O15554 427 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 LDB2O43679 373 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 PRAMEF11O60813 436 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 DNAJC6O75061 913 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 IPO13O94829 963 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 SOD1P00441 154 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 TEAD1P28347 426 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 SDC4P31431 198 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 SLC19A1P41440 591 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 STX17P56962 302 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 DPTQ07507 201 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 PNOCQ13519 176 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 GPR19Q15760 415 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 TAOK1Q7L7X3 1001 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 RAB43Q86YS6 212 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 AVL9Q8NBF6 648 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 EXD1Q8NHP7 514 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 DNAJB14Q8TBM8 379 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 GPT2Q8TD30 523 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 RXFP2Q8WXD0 754 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 KCND1Q9NSA2 647 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 KLC4Q9NSK0 619 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 DOCK4Q8N1I0 1966 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 A0A1W2PQJ5 194 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 WASH4PA8MWX3 477 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 PSMD11O00231 422 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 PEX12O00623 359 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 GRID2O43424 1007 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 KLHL41O60662 606 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 SLC9A1P19634 815 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 SCNN1AP37088 669 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 CAPZBP47756 277 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 GABRB2P47870 512 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 GSDMDP57764 484 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 AP1S1P61966 158 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 Q0VFX4 171 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 ASIC2Q16515 512 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC14Q49A88 953 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 TAF3Q5VWG9 929 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 ISM2Q6H9L7 571 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 SCYL2Q6P3W7 929 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 DSELQ8IZU8 1212 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 FAM172AQ8WUF8 416 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 CPA5Q8WXQ8 436 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 UBXN4Q92575 508 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 COX14Q96I36 57 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 CEP63Q96MT8 703 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 SMIM14Q96QK8 99 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 MAP3K3Q99759 626 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 SLC39A8Q9C0K1 460 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 UCK1Q9HA47 277 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 SP110Q9HB58 689 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-222ENST00000449504 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.05□□□□□ -1.28
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