RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 CYP4F8P98187 520 aa4.1□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 EPS8Q12929 822 aa4.1□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 SLC30A6Q6NXT4 461 aa4.1□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 AFTPHQ6ULP2 937 aa4.1□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 CCDC80Q76M96 950 aa4.1□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 RBFAQ8N0V3 343 aa4.1□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 KCNE4Q8WWG9 221 aa4.1□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 NANOGQ9H9S0 305 aa4.1□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 GMPPBQ9Y5P6 360 aa4.1□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 REM1O75628 298 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 WDPCPO95876 746 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 HSD3B1P14060 373 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 GCNT1Q02742 428 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ACY1Q03154 408 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 TREML2Q5T2D2 321 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ZNF454Q8N9F8 522 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 CAMKVQ8NCB2 501 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.755e-7■■■■□ 24
CENPF-201ENST00000366955 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ASB2Q96Q27 587 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 OCEL1Q9H607 264 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ARL8BQ9NVJ2 186 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 TAS2R14Q9NYV8 317 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 A0A1W2PQ72 361 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 TP53I11O14683 189 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 CLDN11O75508 207 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 MAP3K6O95382 1288 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ABCG1P45844 678 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 NR2C2P49116 596 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ARF1P84077 181 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 DNAJC3Q13217 504 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 LRRC14Q15048 493 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 TRIM61Q5EBN2 209 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 TMEM198Q66K66 360 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 DNM1P34Q6PK57 102 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 LRRC49Q8IUZ0 686 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 OR6N1Q8NGY5 312 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 SH3RF2Q8TEC5 729 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 NINJ1Q92982 152 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 SLC30A2Q9BRI3 323 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 PCDH18Q9HCL0 1135 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 PISDQ9UG56 409 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 CORO2BQ9UQ03 480 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 AP3M1Q9Y2T2 418 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 DCCP43146 1447 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 MYL12BO14950 172 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 OR1F1O43749 312 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 UGT2B4P06133 528 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 OAS2P29728 719 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 NEK3P51956 506 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 SLC6A3Q01959 620 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 SQLEQ14534 574 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 C4orf46Q504U0 113 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ARSIQ5FYB1 569 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 DENND5AQ6IQ26 1287 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ZPBP2Q6X784 338 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 LNX2Q8N448 690 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 THRSPQ92748 146 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 GABRQQ9UN88 632 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 GPR34Q9UPC5 381 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 RGPD2P0DJD1 1756 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 CNTFP26441 200 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 MGAT1P26572 445 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 PDHA2P29803 388 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 CCR10P46092 362 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 BRCC3P46736 316 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 NME5P56597 212 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 CDH17Q12864 832 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 PDZK1Q5T2W1 519 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 BEND4Q6ZU67 534 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 MUCL1Q96DR8 90 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 AIFM3Q96NN9 605 aa4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms