RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM63Q969Q1 353 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 MCRS1Q96EZ8 462 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 FZD10Q9ULW2 581 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 TIPRLO75663 272 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 NR1D2Q14995 579 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 FAM124AQ86V42 546 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 LEMD2Q8NC56 503 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 S100A14Q9HCY8 104 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 RIPK1Q13546 671 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 OR2T3Q8NH03 318 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 COQ6Q9Y2Z9 468 aa20.14■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ASLP04424 464 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 EPHX1P07099 455 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 GPD2P43304 727 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PLD4Q96BZ4 506 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 UROSP10746 265 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM8Q9BZR9 551 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 NR2E1Q9Y466 385 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CPQQ9Y646 472 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 HSPA7P48741 367 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 DAW1Q8N136 415 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 FITM2Q8N6M3 262 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PSMG2Q969U7 264 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CCL16O15467 120 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ECDO95905 644 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PIGRP01833 764 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 NMBRP28336 390 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PTGER3P43115 390 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CYP1B1Q16678 543 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 GPR135Q8IZ08 494 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 TLCD1Q96CP7 247 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SEC14L3Q9UDX4 400 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PTPRJQ12913 1337 aa20.13■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CAPN1P07384 714 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ASPAP45381 313 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CYP4F2P78329 520 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 DPYSL2Q16555 572 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 MTX3Q5HYI7 312 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 FETUBQ9UGM5 382 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CDH22Q9UJ99 828 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 U3KQV3 271 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R41P59536 307 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 OLR1P78380 273 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 GPR107Q5VW38 600 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PTCHD4Q6ZW05 846 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 OGNP20774 298 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CYP4F3Q08477 520 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CCL22O00626 93 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 LGR5O75473 907 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 RHAGQ02094 409 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 VPS26BQ4G0F5 336 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 AGAP2Q99490 1192 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SYT17Q9BSW7 474 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 GRHL1Q9NZI5 618 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 MAT2BQ9NZL9 334 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SSR3Q9UNL2 185 aa20.12■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 C3P01024 1663 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 ELOVL7A1L3X0 281 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJA2O60884 412 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 UGT2B17O75795 530 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 FECHP22830 423 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 AQP1P29972 269 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 LPGAT1Q92604 370 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 NTAN1Q96AB6 310 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 SCN2BO60939 215 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 TMCC2O75069 709 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 RALGDSQ12967 914 aa20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CCSAP-203ENST00000366687 XAGE5Q8WWM1 108 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms