RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	CEACAM5	P06731	702 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	MLN	P12872	115 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	DGKA	P23743	735 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	ITGA8	P53708	1063 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	PRAME	P78395	509 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	SLC14A1	Q13336	389 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	GTF2H3	Q13889	308 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	HOOK3	Q86VS8	718 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	NAXD	Q8IW45	347 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	SAP25	Q8TEE9	199 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	TBATA	Q96M53	351 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	TTC25	Q96NG3	672 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	VPS35	Q96QK1	796 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC61	Q9BV99	259 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	OR2AG1	Q9H205	316 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		24.71	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	SLC30A4	O14863	429 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	FLRT2	O43155	660 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	AQP9	O43315	295 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHGA12	O60330	932 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CD59	P13987	128 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CALCOCO2	Q13137	446 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	NFATC2	Q13469	925 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PEX6	Q13608	980 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	MORF4L2	Q15014	288 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	MPP5	Q8N3R9	675 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF778	Q96MU6	729 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	RAB17	Q9H0T7	212 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		24.7	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PIEZO1	Q92508	2521 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	OR51F1	A6NGY5	319 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	NDC80	O14777	642 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	SH3BP5	O60239	455 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	SDHB	P21912	280 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	IVD	P26440	423 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	GRK6	P43250	576 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ARSD	P51689	593 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	XIAP	P98170	497 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CES3	Q6UWW8	571 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	SNX20	Q7Z614	316 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	EID2	Q8N6I1	236 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CEP112	Q8N8E3	955 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	BBOF1	Q8ND07	529 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	HDAC10	Q969S8	669 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ULK4	Q96C45	1275 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ERP44	Q9BS26	406 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	VPS18	Q9P253	973 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		24.69	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	NEMP2	A6NFY4	417 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ESPN	B1AK53	854 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	IVL	P07476	585 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ALPPL2	P10696	532 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	NMBR	P28336	390 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ELOC	Q15369	112 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	OR2M4	Q96R27	311 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	SOX13	Q9UN79	622 aa		24.68	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229		H7C0S8	307 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CDK14	O94921	469 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ANXA6	P08133	673 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PRSS56	P0CW18	603 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	MSH3	P20585	1137 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CA5A	P35218	305 aa		24.67	■■□□□ 1.54

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