RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513072.1

ANKRD40-203, Transcript of ankyrin repeat domain 40, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD40, Length 848 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40-203ENST00000513072 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 VPS37AQ8NEZ2 397 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 ZNF778Q96MU6 729 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 MECRQ9BV79 373 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 ARL8BQ9NVJ2 186 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 STK39Q9UEW8 545 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 GMEB2Q9UKD1 530 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 KCNJ14Q9UNX9 436 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 COL4A2P08572 1712 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 LAMA5O15230 3695 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 A0A1B0GUA9 196 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 TADA2AO75478 443 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 ECI2O75521 394 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 SEC24AO95486 1093 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 PLAUP00749 431 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 RFPL3SP0C7P2 107 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 CHRNB1P11230 501 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 CDK4P11802 303 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 IFNAR1P17181 557 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 TKTP29401 623 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 HOXA9P31269 272 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 SLC8A1P32418 973 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 OR1D2P34982 312 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 BRCC3P46736 316 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 SOX2P48431 317 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 RPL15P61313 204 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 ROR1Q01973 937 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 BIRC2Q13490 618 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 CBFBQ13951 182 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 ZNF425Q6IV72 752 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 VITQ6UXI7 678 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 ZNF852Q6ZMS4 543 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 DEF8Q6ZN54 512 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 C4orf19Q8IY42 314 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 EXD3Q8N9H8 876 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 CNNM3Q8NE01 707 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 CCDC148Q8NFR7 591 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 STT3BQ8TCJ2 826 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 BICD2Q8TD16 824 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 BCAS4Q8TDM0 211 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 PMM1Q92871 262 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 COQ8BQ96D53 544 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 CCDC51Q96ER9 411 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 FAR2Q96K12 515 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 LRRC3BQ96PB8 259 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 KIFC3Q9BVG8 833 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 AGXT2Q9BYV1 514 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 SLC29A3Q9BZD2 475 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 PDZD7Q9H5P4 517 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 LMAN1LQ9HAT1 526 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 POLD4Q9HCU8 107 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 UBN1Q9NPG3 1134 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 NFU1Q9UMS0 254 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 CNTN6Q9UQ52 1028 aa5.55□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 SLITRK3O94933 977 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 RETP07949 1114 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 IGFBP2P18065 325 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 RPS6KB1P23443 525 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 CCNE1P24864 410 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 AXLP30530 894 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 GDI1P31150 447 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 AKT1P31749 480 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 MAGEA9P43362 315 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 CLCNKBP51801 687 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 FOXO1Q12778 655 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 STXBP5Q5T5C0 1151 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 NCAPH2Q6IBW4 605 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 TCEAL6Q6IPX3 200 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 ANO7Q6IWH7 933 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 LIN54Q6MZP7 749 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 WDR93Q6P2C0 686 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 SLC27A1Q6PCB7 646 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 MOXD1Q6UVY6 613 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 BLIDQ8IZY5 108 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 PIGOQ8TEQ8 1089 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 TCP11Q8WWU5 503 aa5.54□□□□□ -1.52
ANKRD40-203ENST00000513072 FAM3CQ92520 227 aa5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms