RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rab20P35295 233 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 FaslgP41047 279 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tubgcp3P58854 905 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rpl26P61255 145 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Polr2lP62876 67 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rpl22P67984 128 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tgm3Q08189 693 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gdpd4Q3TT99 632 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mylk3Q3UIZ8 795 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Itga1Q3V3R4 1179 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tsr1Q5SWD9 803 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PtprrQ62132 656 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tead4Q62296 427 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Srsf1Q6PDM2 248 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 LnpkQ7TQ95 425 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q8BGK9 164 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dtd2Q8BHA3 168 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc18a2Q8BRU6 517 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Klhl7Q8BUL5 586 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 1700001C19RikQ8K168 210 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gpn2Q8VEJ1 310 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Depdc7Q91WS7 511 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mbd1Q9Z2E2 636 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Col6a6Q8C6K9 2265 aa21.48■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr1049A2ARZ0 308 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kif3cO35066 796 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CrymO54983 313 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mtnd3P03899 115 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SpnP15702 395 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atxn10P28658 475 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lpar5Q149R9 372 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ndufaf2Q59J78 168 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pnliprp1Q5BKQ4 473 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Map3k3Q61084 626 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fzd4Q61088 537 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ankrd6Q69ZU8 712 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AasdhQ80WC9 1100 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pdcl3Q8BVF2 240 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp263Q8CF60 680 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Spata2Q8K004 515 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cdt1Q8R4E9 557 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ubl7Q91W67 380 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Decr1Q9CQ62 335 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppil1Q9D0W5 166 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmco5aQ9D9D5 303 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem174Q9DCX7 243 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tsc1Q9EP53 1161 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SigirrQ9JLZ8 409 aa21.47■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vps13cQ8BX70 3748 aa21.46■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vmn2r51L7N215 852 aa21.46■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Man2b2O54782 1018 aa21.46■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MuskQ61006 868 aa21.46■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pdcl2Q78Y63 240 aa21.46■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tbc1d17Q8BYH7 645 aa21.46■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kiaa2013Q91X21 634 aa21.46■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DcxrQ91X52 244 aa21.46■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sytl1Q99N80 567 aa21.46■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mrps17Q9CQE3 120 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dusp12Q9D0T2 339 aa21.46■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PlekQ9JHK5 350 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ecel1Q9JMI0 775 aa21.46■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trpc4Q9QUQ5 974 aa21.46■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa21.46■■□□□ 1.03
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cep192E9Q4Y4 2514 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 FcmrA1KXC4 422 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp395E9Q5N9 508 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ifi206G3UZV2 921 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp846G3X996 541 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vmn2r9K7N6Z8 848 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hoxa4P06798 285 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Becn2P0DM65 447 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 ElnP54320 860 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rab6bP61294 208 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc7a10P63115 530 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 UtyP79457 1212 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ptprn2P80560 1001 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Top1Q04750 767 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Foxk2Q3UCQ1 651 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam35aQ3UEN2 891 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kcnc3Q63959 769 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ttc34Q8C0Q3 554 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dr1Q91WV0 176 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 TmlheQ91ZE0 421 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 GpnmbQ99P91 574 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ska2Q9CR46 120 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 RpainQ9CWY9 219 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppil6Q9D6D8 278 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 ItpaQ9D892 198 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rexo2Q9D8S4 237 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Glipr1l1Q9DAG6 236 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cldn19Q9ET38 224 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CtsmQ9JL96 333 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MioxQ9QXN5 285 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Eif3iQ9QZD9 325 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nme3Q9WV85 169 aa21.45■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MntO08789 591 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 P01641 117 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Got2P05202 430 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PdgfrbP05622 1098 aa21.44■■□□□ 1.02
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sbk3P0C5K0 361 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.8 ms