Protein–RNA interactions for Protein: Q61088

Fzd4, Frizzled-4, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fzd4Q61088 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
Fzd4Q61088 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Fzd4Q61088 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Fzd4Q61088 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Fzd4Q61088 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Fzd4Q61088 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Fzd4Q61088 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Fzd4Q61088 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Fzd4Q61088 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fzd4Q61088 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fzd4Q61088 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Fzd4Q61088 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Fzd4Q61088 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Fzd4Q61088 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Fzd4Q61088 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Fzd4Q61088 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Fzd4Q61088 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fzd4Q61088 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Fzd4Q61088 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fzd4Q61088 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Fzd4Q61088 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fzd4Q61088 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Fzd4Q61088 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fzd4Q61088 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Fzd4Q61088 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fzd4Q61088 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Fzd4Q61088 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fzd4Q61088 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Fzd4Q61088 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Fzd4Q61088 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fzd4Q61088 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fzd4Q61088 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Fzd4Q61088 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Fzd4Q61088 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Fzd4Q61088 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fzd4Q61088 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fzd4Q61088 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Fzd4Q61088 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fzd4Q61088 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Fzd4Q61088 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fzd4Q61088 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fzd4Q61088 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fzd4Q61088 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Fzd4Q61088 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Fzd4Q61088 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Fzd4Q61088 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fzd4Q61088 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fzd4Q61088 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Fzd4Q61088 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Fzd4Q61088 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fzd4Q61088 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Fzd4Q61088 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fzd4Q61088 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fzd4Q61088 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fzd4Q61088 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fzd4Q61088 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Fzd4Q61088 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Fzd4Q61088 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fzd4Q61088 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fzd4Q61088 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fzd4Q61088 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fzd4Q61088 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fzd4Q61088 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fzd4Q61088 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fzd4Q61088 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fzd4Q61088 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Fzd4Q61088 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fzd4Q61088 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fzd4Q61088 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Fzd4Q61088 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fzd4Q61088 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Fzd4Q61088 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fzd4Q61088 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fzd4Q61088 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fzd4Q61088 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fzd4Q61088 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fzd4Q61088 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fzd4Q61088 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fzd4Q61088 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fzd4Q61088 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fzd4Q61088 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Fzd4Q61088 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fzd4Q61088 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fzd4Q61088 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Fzd4Q61088 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fzd4Q61088 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fzd4Q61088 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fzd4Q61088 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fzd4Q61088 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Fzd4Q61088 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fzd4Q61088 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fzd4Q61088 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fzd4Q61088 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fzd4Q61088 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fzd4Q61088 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fzd4Q61088 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fzd4Q61088 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fzd4Q61088 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fzd4Q61088 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fzd4Q61088 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms