Protein–RNA interactions for Protein: Q91W67

Ubl7, Ubiquitin-like protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl7Q91W67 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Ubl7Q91W67 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ubl7Q91W67 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ubl7Q91W67 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Ubl7Q91W67 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Ubl7Q91W67 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ubl7Q91W67 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ubl7Q91W67 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ubl7Q91W67 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ubl7Q91W67 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Ubl7Q91W67 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ubl7Q91W67 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ubl7Q91W67 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ubl7Q91W67 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ubl7Q91W67 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ubl7Q91W67 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ubl7Q91W67 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ubl7Q91W67 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ubl7Q91W67 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ubl7Q91W67 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ubl7Q91W67 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ubl7Q91W67 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ubl7Q91W67 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ubl7Q91W67 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ubl7Q91W67 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ubl7Q91W67 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ubl7Q91W67 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ubl7Q91W67 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ubl7Q91W67 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ubl7Q91W67 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ubl7Q91W67 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ubl7Q91W67 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ubl7Q91W67 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ubl7Q91W67 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubl7Q91W67 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubl7Q91W67 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubl7Q91W67 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ubl7Q91W67 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubl7Q91W67 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubl7Q91W67 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ubl7Q91W67 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ubl7Q91W67 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubl7Q91W67 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ubl7Q91W67 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubl7Q91W67 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubl7Q91W67 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubl7Q91W67 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubl7Q91W67 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubl7Q91W67 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubl7Q91W67 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ubl7Q91W67 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ubl7Q91W67 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ubl7Q91W67 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ubl7Q91W67 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ubl7Q91W67 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ubl7Q91W67 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ubl7Q91W67 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubl7Q91W67 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubl7Q91W67 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubl7Q91W67 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubl7Q91W67 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubl7Q91W67 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl7Q91W67 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ubl7Q91W67 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ubl7Q91W67 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ubl7Q91W67 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ubl7Q91W67 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ubl7Q91W67 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubl7Q91W67 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ubl7Q91W67 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ubl7Q91W67 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ubl7Q91W67 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubl7Q91W67 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ubl7Q91W67 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ubl7Q91W67 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ubl7Q91W67 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubl7Q91W67 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ubl7Q91W67 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ubl7Q91W67 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ubl7Q91W67 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ubl7Q91W67 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl7Q91W67 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ubl7Q91W67 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ubl7Q91W67 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ubl7Q91W67 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ubl7Q91W67 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubl7Q91W67 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ubl7Q91W67 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ubl7Q91W67 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ubl7Q91W67 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ubl7Q91W67 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ubl7Q91W67 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ubl7Q91W67 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubl7Q91W67 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubl7Q91W67 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ubl7Q91W67 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ubl7Q91W67 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ubl7Q91W67 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubl7Q91W67 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubl7Q91W67 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms