Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Atxn10P28658 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Atxn10P28658 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Atxn10P28658 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Atxn10P28658 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Atxn10P28658 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Atxn10P28658 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Atxn10P28658 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Atxn10P28658 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Atxn10P28658 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Atxn10P28658 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Atxn10P28658 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Atxn10P28658 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Atxn10P28658 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Atxn10P28658 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Atxn10P28658 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Atxn10P28658 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Atxn10P28658 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Atxn10P28658 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Atxn10P28658 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Atxn10P28658 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Atxn10P28658 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Atxn10P28658 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Atxn10P28658 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Atxn10P28658 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Atxn10P28658 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Atxn10P28658 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Atxn10P28658 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Atxn10P28658 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Atxn10P28658 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Atxn10P28658 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Atxn10P28658 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Atxn10P28658 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Atxn10P28658 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Atxn10P28658 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Atxn10P28658 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Atxn10P28658 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Atxn10P28658 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Atxn10P28658 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Atxn10P28658 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Atxn10P28658 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Atxn10P28658 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Atxn10P28658 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Atxn10P28658 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atxn10P28658 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Atxn10P28658 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atxn10P28658 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Atxn10P28658 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atxn10P28658 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Atxn10P28658 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Atxn10P28658 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Atxn10P28658 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atxn10P28658 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atxn10P28658 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atxn10P28658 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atxn10P28658 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atxn10P28658 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atxn10P28658 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Atxn10P28658 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atxn10P28658 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atxn10P28658 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atxn10P28658 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Atxn10P28658 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atxn10P28658 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atxn10P28658 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Atxn10P28658 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Atxn10P28658 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Atxn10P28658 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atxn10P28658 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Atxn10P28658 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Atxn10P28658 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Atxn10P28658 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Atxn10P28658 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Atxn10P28658 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Atxn10P28658 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Atxn10P28658 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Atxn10P28658 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Atxn10P28658 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atxn10P28658 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atxn10P28658 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atxn10P28658 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atxn10P28658 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atxn10P28658 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atxn10P28658 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atxn10P28658 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atxn10P28658 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atxn10P28658 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atxn10P28658 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atxn10P28658 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atxn10P28658 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atxn10P28658 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atxn10P28658 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atxn10P28658 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atxn10P28658 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atxn10P28658 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atxn10P28658 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atxn10P28658 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atxn10P28658 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atxn10P28658 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atxn10P28658 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms