RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Naaladl1Q7M758 745 aa6.57□□□□□ -1.36
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 DrgxQ8BYH0 263 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Parp12Q8BZ20 711 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cacnb2Q8CC27 655 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gin1Q8K259 518 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trib2Q8K4K3 343 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AcmsdQ8R519 336 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Unc93b1Q8VCW4 598 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr695Q8VFM3 315 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lgals12Q91VD1 314 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hdac11Q91WA3 347 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdkal1Q91WE6 578 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Basp1Q91XV3 226 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdha8Q91Y12 946 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc35a5Q921R7 437 aa6.57□□□□□ -1.36
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dhx34Q9DBV3 1145 aa6.57□□□□□ -1.36
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptchd4B9EKX1 904 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kctd18E0CZ26 429 aa6.57□□□□□ -1.36
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Obox5G3X9P6 291 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3043K7N693 218 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm16440K7N6G6 218 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm2244L7N2A3 218 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3278L7N2D2 218 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm8271L7N2E2 218 aa6.57□□□□□ -1.36
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 PthlhP22858 175 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Anxa5P48036 319 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ErfP70459 551 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TgfbiP82198 683 aa6.57□□□□□ -1.36
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 LcorlQ3U285 600 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cmpk2Q3U5Q7 447 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pacs2Q3V3Q7 862 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q5EBG8 199 aa6.57□□□□□ -1.36
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp1r26Q6A025 1163 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt72Q6IME9 520 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kmt5cQ6Q783 468 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr834Q7TRG8 312 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arl5aQ80ZU0 179 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8BP99 230 aa6.57□□□□□ -1.36
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 AdprmQ99KS6 340 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MajinQ9D992 256 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndst3Q9EQH7 873 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smad9Q9JIW5 430 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bcl10Q9Z0H7 233 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 S1pr4Q9Z0L1 386 aa6.57□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TriobpQ99KW3 2014 aa6.57□□□□□ -1.36
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Supt3B0QZW4 406 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Erich1E9PY43 332 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r17E9PYF5 849 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r38G3UYA8 861 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r33K7N705 861 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fkbp7O54998 218 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 P01664 111 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtnd4P03911 459 aa6.56□□□□□ -1.36
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 MelkQ61846 643 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CcncQ62447 283 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 A4galtQ67BJ4 359 aa6.56□□□□□ -1.36
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Csnk1g1Q8BTH8 459 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ManbaQ8K2I4 879 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zcchc9Q8R1J3 271 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r198Q8R263 300 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Micu1Q8VCX5 477 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2c50Q91X77 490 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd209eQ91ZW7 208 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CutalQ9D1U5 156 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Efcab1Q9D3N2 212 aa6.56□□□□□ -1.36
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pold3Q9EQ28 462 aa6.56□□□□□ -1.36
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