Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ26

Kctd18, Potassium channel tetramerisation domain containing 18, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd18E0CZ26 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Kctd18E0CZ26 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Kctd18E0CZ26 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Kctd18E0CZ26 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kctd18E0CZ26 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Kctd18E0CZ26 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kctd18E0CZ26 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Kctd18E0CZ26 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Kctd18E0CZ26 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Kctd18E0CZ26 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Kctd18E0CZ26 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Kctd18E0CZ26 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Kctd18E0CZ26 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Kctd18E0CZ26 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Kctd18E0CZ26 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Kctd18E0CZ26 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Kctd18E0CZ26 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Kctd18E0CZ26 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Kctd18E0CZ26 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Kctd18E0CZ26 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Kctd18E0CZ26 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Kctd18E0CZ26 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Kctd18E0CZ26 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Kctd18E0CZ26 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Kctd18E0CZ26 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Kctd18E0CZ26 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Kctd18E0CZ26 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Kctd18E0CZ26 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Kctd18E0CZ26 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Kctd18E0CZ26 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Kctd18E0CZ26 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Kctd18E0CZ26 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Kctd18E0CZ26 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Kctd18E0CZ26 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kctd18E0CZ26 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Kctd18E0CZ26 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Kctd18E0CZ26 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Kctd18E0CZ26 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Kctd18E0CZ26 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Kctd18E0CZ26 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Kctd18E0CZ26 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Kctd18E0CZ26 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Kctd18E0CZ26 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Kctd18E0CZ26 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kctd18E0CZ26 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Kctd18E0CZ26 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kctd18E0CZ26 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kctd18E0CZ26 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kctd18E0CZ26 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Kctd18E0CZ26 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Kctd18E0CZ26 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kctd18E0CZ26 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Kctd18E0CZ26 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Kctd18E0CZ26 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kctd18E0CZ26 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kctd18E0CZ26 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Kctd18E0CZ26 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kctd18E0CZ26 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kctd18E0CZ26 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
Kctd18E0CZ26 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Kctd18E0CZ26 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Kctd18E0CZ26 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kctd18E0CZ26 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kctd18E0CZ26 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kctd18E0CZ26 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kctd18E0CZ26 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kctd18E0CZ26 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kctd18E0CZ26 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kctd18E0CZ26 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kctd18E0CZ26 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kctd18E0CZ26 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kctd18E0CZ26 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kctd18E0CZ26 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kctd18E0CZ26 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Kctd18E0CZ26 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kctd18E0CZ26 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kctd18E0CZ26 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Kctd18E0CZ26 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Kctd18E0CZ26 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kctd18E0CZ26 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kctd18E0CZ26 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kctd18E0CZ26 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kctd18E0CZ26 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Kctd18E0CZ26 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kctd18E0CZ26 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kctd18E0CZ26 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kctd18E0CZ26 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kctd18E0CZ26 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kctd18E0CZ26 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kctd18E0CZ26 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kctd18E0CZ26 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kctd18E0CZ26 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kctd18E0CZ26 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kctd18E0CZ26 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kctd18E0CZ26 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kctd18E0CZ26 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kctd18E0CZ26 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kctd18E0CZ26 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kctd18E0CZ26 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kctd18E0CZ26 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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