Protein–RNA interactions for Protein: Q8R263

Vmn1r198, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r198Q8R263 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Vmn1r198Q8R263 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,52■■■□□ 2,64
Vmn1r198Q8R263 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Vmn1r198Q8R263 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,27■■■□□ 2,6
Vmn1r198Q8R263 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,74■■■□□ 2,51
Vmn1r198Q8R263 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Vmn1r198Q8R263 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Vmn1r198Q8R263 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Vmn1r198Q8R263 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Vmn1r198Q8R263 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Vmn1r198Q8R263 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Vmn1r198Q8R263 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Vmn1r198Q8R263 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Vmn1r198Q8R263 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Vmn1r198Q8R263 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Vmn1r198Q8R263 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Vmn1r198Q8R263 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,74■■■□□ 2,19
Vmn1r198Q8R263 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Vmn1r198Q8R263 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Vmn1r198Q8R263 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Vmn1r198Q8R263 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Vmn1r198Q8R263 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Vmn1r198Q8R263 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Vmn1r198Q8R263 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Vmn1r198Q8R263 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Vmn1r198Q8R263 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Vmn1r198Q8R263 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Vmn1r198Q8R263 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Vmn1r198Q8R263 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Vmn1r198Q8R263 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,81■■■□□ 2,04
Vmn1r198Q8R263 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Vmn1r198Q8R263 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Vmn1r198Q8R263 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Vmn1r198Q8R263 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Vmn1r198Q8R263 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Vmn1r198Q8R263 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Vmn1r198Q8R263 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Vmn1r198Q8R263 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,6■■■□□ 2,01
Vmn1r198Q8R263 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Vmn1r198Q8R263 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
Vmn1r198Q8R263 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Vmn1r198Q8R263 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Vmn1r198Q8R263 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Vmn1r198Q8R263 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Vmn1r198Q8R263 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Vmn1r198Q8R263 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Vmn1r198Q8R263 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Vmn1r198Q8R263 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Vmn1r198Q8R263 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Vmn1r198Q8R263 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Vmn1r198Q8R263 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Vmn1r198Q8R263 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Vmn1r198Q8R263 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Vmn1r198Q8R263 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Vmn1r198Q8R263 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Vmn1r198Q8R263 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Vmn1r198Q8R263 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Vmn1r198Q8R263 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Vmn1r198Q8R263 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Vmn1r198Q8R263 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Vmn1r198Q8R263 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Vmn1r198Q8R263 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Vmn1r198Q8R263 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,68■■□□□ 1,86
Vmn1r198Q8R263 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Vmn1r198Q8R263 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Vmn1r198Q8R263 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Vmn1r198Q8R263 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Vmn1r198Q8R263 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Vmn1r198Q8R263 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Vmn1r198Q8R263 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Vmn1r198Q8R263 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Vmn1r198Q8R263 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Vmn1r198Q8R263 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Vmn1r198Q8R263 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Vmn1r198Q8R263 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Vmn1r198Q8R263 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Vmn1r198Q8R263 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Vmn1r198Q8R263 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Vmn1r198Q8R263 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Vmn1r198Q8R263 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Vmn1r198Q8R263 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Vmn1r198Q8R263 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Vmn1r198Q8R263 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Vmn1r198Q8R263 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,07■■□□□ 1,76
Vmn1r198Q8R263 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Vmn1r198Q8R263 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Vmn1r198Q8R263 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Vmn1r198Q8R263 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Vmn1r198Q8R263 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Vmn1r198Q8R263 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Vmn1r198Q8R263 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Vmn1r198Q8R263 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Vmn1r198Q8R263 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Vmn1r198Q8R263 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Vmn1r198Q8R263 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Vmn1r198Q8R263 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Vmn1r198Q8R263 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Vmn1r198Q8R263 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Vmn1r198Q8R263 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Vmn1r198Q8R263 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms