Protein–RNA interactions for Protein: Q67BJ4

A4galt, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4galtQ67BJ4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
A4galtQ67BJ4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
A4galtQ67BJ4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
A4galtQ67BJ4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
A4galtQ67BJ4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.14■■■□□ 2.57
A4galtQ67BJ4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
A4galtQ67BJ4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
A4galtQ67BJ4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
A4galtQ67BJ4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
A4galtQ67BJ4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
A4galtQ67BJ4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
A4galtQ67BJ4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
A4galtQ67BJ4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
A4galtQ67BJ4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
A4galtQ67BJ4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
A4galtQ67BJ4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
A4galtQ67BJ4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
A4galtQ67BJ4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
A4galtQ67BJ4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
A4galtQ67BJ4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
A4galtQ67BJ4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
A4galtQ67BJ4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
A4galtQ67BJ4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A4galtQ67BJ4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
A4galtQ67BJ4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
A4galtQ67BJ4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
A4galtQ67BJ4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
A4galtQ67BJ4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
A4galtQ67BJ4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
A4galtQ67BJ4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
A4galtQ67BJ4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
A4galtQ67BJ4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
A4galtQ67BJ4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
A4galtQ67BJ4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
A4galtQ67BJ4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
A4galtQ67BJ4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
A4galtQ67BJ4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
A4galtQ67BJ4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
A4galtQ67BJ4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
A4galtQ67BJ4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A4galtQ67BJ4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
A4galtQ67BJ4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
A4galtQ67BJ4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A4galtQ67BJ4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A4galtQ67BJ4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A4galtQ67BJ4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A4galtQ67BJ4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A4galtQ67BJ4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A4galtQ67BJ4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A4galtQ67BJ4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A4galtQ67BJ4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
A4galtQ67BJ4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A4galtQ67BJ4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A4galtQ67BJ4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A4galtQ67BJ4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A4galtQ67BJ4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
A4galtQ67BJ4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A4galtQ67BJ4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A4galtQ67BJ4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A4galtQ67BJ4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A4galtQ67BJ4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A4galtQ67BJ4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A4galtQ67BJ4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
A4galtQ67BJ4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A4galtQ67BJ4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
A4galtQ67BJ4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A4galtQ67BJ4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
A4galtQ67BJ4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
A4galtQ67BJ4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
A4galtQ67BJ4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
A4galtQ67BJ4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A4galtQ67BJ4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A4galtQ67BJ4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A4galtQ67BJ4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A4galtQ67BJ4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A4galtQ67BJ4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A4galtQ67BJ4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A4galtQ67BJ4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A4galtQ67BJ4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A4galtQ67BJ4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A4galtQ67BJ4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
A4galtQ67BJ4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
A4galtQ67BJ4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A4galtQ67BJ4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A4galtQ67BJ4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A4galtQ67BJ4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A4galtQ67BJ4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A4galtQ67BJ4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
A4galtQ67BJ4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
A4galtQ67BJ4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
A4galtQ67BJ4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
A4galtQ67BJ4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A4galtQ67BJ4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A4galtQ67BJ4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
A4galtQ67BJ4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
A4galtQ67BJ4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
A4galtQ67BJ4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A4galtQ67BJ4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A4galtQ67BJ4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
A4galtQ67BJ4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms