Protein–RNA interactions for Protein: O70435

Psma3, Proteasome subunit alpha type-3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma3O70435 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,54■■■■□ 3,6
Psma3O70435 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,75■■■■□ 3,15
Psma3O70435 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,11
Psma3O70435 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Psma3O70435 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Psma3O70435 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,64■■■□□ 2,98
Psma3O70435 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,26■■■□□ 2,91
Psma3O70435 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,68■■■□□ 2,82
Psma3O70435 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Psma3O70435 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,38■■■□□ 2,77
Psma3O70435 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,29■■■□□ 2,76
Psma3O70435 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Psma3O70435 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,89■■■□□ 2,7
Psma3O70435 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Psma3O70435 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Psma3O70435 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Psma3O70435 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,4■■■□□ 2,62
Psma3O70435 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Psma3O70435 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Psma3O70435 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Psma3O70435 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Psma3O70435 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Psma3O70435 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Psma3O70435 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Psma3O70435 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,16■■■□□ 2,58
Psma3O70435 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Psma3O70435 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Psma3O70435 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Psma3O70435 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Psma3O70435 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Psma3O70435 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Psma3O70435 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Psma3O70435 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Psma3O70435 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Psma3O70435 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,49■■■□□ 2,47
Psma3O70435 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Psma3O70435 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Psma3O70435 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,44
Psma3O70435 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Psma3O70435 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Psma3O70435 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Psma3O70435 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Psma3O70435 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Psma3O70435 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Psma3O70435 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Psma3O70435 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Psma3O70435 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Psma3O70435 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Psma3O70435 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Psma3O70435 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Psma3O70435 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Psma3O70435 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Psma3O70435 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,51■■■□□ 2,31
Psma3O70435 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Psma3O70435 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Psma3O70435 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Psma3O70435 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Psma3O70435 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Psma3O70435 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Psma3O70435 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,3■■■□□ 2,28
Psma3O70435 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Psma3O70435 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Psma3O70435 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Psma3O70435 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Psma3O70435 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Psma3O70435 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Psma3O70435 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Psma3O70435 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Psma3O70435 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Psma3O70435 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,11■■■□□ 2,25
Psma3O70435 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Psma3O70435 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Psma3O70435 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Psma3O70435 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Psma3O70435 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Psma3O70435 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Psma3O70435 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Psma3O70435 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Psma3O70435 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Psma3O70435 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Psma3O70435 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Psma3O70435 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Psma3O70435 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Psma3O70435 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Psma3O70435 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Psma3O70435 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Psma3O70435 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Psma3O70435 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Psma3O70435 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Psma3O70435 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Psma3O70435 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Psma3O70435 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Psma3O70435 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Psma3O70435 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Psma3O70435 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Psma3O70435 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Psma3O70435 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Psma3O70435 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Psma3O70435 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Psma3O70435 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,6 ms