RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 DOCK4Q8N1I0 1966 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 PIK3R6Q5UE93 754 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 ZBTB26Q9HCK0 441 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 VWA8A3KMH1 1905 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 NPHS1O60500 1241 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 GMNNO75496 209 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 CKMT2P17540 419 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 HERC3Q15034 1050 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 DDR2Q16832 855 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 CNSTQ6PJW8 725 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 KDELC1Q6UW63 502 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 MROQ9BYG7 248 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 KLQ9UEF7 1012 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 VPS28Q9UK41 221 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.08■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 CCL22O00626 93 aa20.08■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 PEX11BO96011 259 aa20.08■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 OR1G1P47890 313 aa20.08■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 CSHL1Q14406 222 aa20.08■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 C11orf74Q86VG3 221 aa20.08■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 LILRB4Q8NHJ6 448 aa20.08■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa20.08■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 SCML2Q9UQR0 700 aa20.08■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HPS6-201ENST00000299238 A0A087X1B8 175 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 JRKO75564 520 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 OAZ2O95190 189 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 CKBP12277 381 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 PAMP19021 973 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 KCNA5P22460 613 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 WNT3AP56704 352 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 POU4F1Q01851 419 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 OR7G1Q8NGA0 311 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 NACC2Q96BF6 587 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 SERPINI1Q99574 410 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 PSD2Q9BQI7 771 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 RNF38Q9H0F5 515 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 POMKQ9H5K3 350 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 AP4S1Q9Y587 144 aa20.08■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 CLIC3O95833 236 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 CPB1P15086 417 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 GRK4P32298 578 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 HPCAL1P37235 193 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 DNAJB13P59910 316 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 MBTPS1Q14703 1052 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 NEDD8Q15843 81 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 ANKRD60Q9BZ19 345 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 WDR41Q9HAD4 459 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 TBC1D13Q9NVG8 400 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 BCAP29Q9UHQ4 241 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 TLR6Q9Y2C9 796 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 SNX13Q9Y5W8 968 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 SDHDO14521 159 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 MT-CO1P00395 513 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 MAXP61244 160 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 INAVAQ3KP66 663 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 IL31Q6EBC2 164 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 GK5Q6ZS86 529 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 MON1AQ86VX9 555 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 FEM1CQ96JP0 617 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 ATP13A1Q9HD20 1204 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa20.07■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.06■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 CLOCKO15516 846 aa20.06■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 TADA2AO75478 443 aa20.06■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 EOMESO95936 686 aa20.06■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 HDCP19113 662 aa20.06■□□□□ 0.8
HPS6-201ENST00000299238 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms