RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 RhoqQ8R527 205 aa21.78■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc5a9Q8VDT1 685 aa21.78■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr570Q8VH12 312 aa21.78■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Crtc3Q91X84 619 aa21.78■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dctn2Q99KJ8 402 aa21.78■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ArntlQ9WTL8 632 aa21.78■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm3604A0A087WPN2 559 aa21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr1200A2ATJ4 336 aa21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pbx3O35317 434 aa21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 BhmtO35490 407 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ptpn20O55082 426 aa21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dnmt3aO88508 908 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PrlrQ08501 608 aa21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tekt4Q149S1 447 aa21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Akr1clQ3UXL1 322 aa21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ubtd2Q6PGH0 234 aa21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam78aQ8C552 283 aa21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zswim3Q8CFL8 695 aa21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr183Q8VFB9 309 aa21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Il1rl2Q9ERS7 574 aa21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atg2aQ6P4T0 1914 aa21.77■■□□□ 1.08
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 UtrnE9Q6R7 3430 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm3739L7N296 216 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fkbp7O54998 218 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rhox6O70238 227 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Enpp1P06802 906 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Agtr2P35374 363 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cct8P42932 548 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NadkP58058 439 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fmo5P97872 533 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gpatch4Q3TFK5 415 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cmpk2Q3U5Q7 447 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sorbs2Q3UTJ2 1180 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mtmr12Q80TA6 747 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zmpste24Q80W54 475 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Thoc5Q8BKT7 683 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sfr1Q8BP27 319 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Acsl5Q8JZR0 683 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zdhhc12Q8VC90 267 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Asz1Q8VD46 475 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dhrs4Q99LB2 279 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmbim6Q9D2C7 237 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Smok1Q9QYZ4 484 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Scn8aQ9WTU3 1978 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm10479K7N6H4 105 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eno2P17183 434 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 LcorlQ3U285 600 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Brsk1Q5RJI5 778 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lcp2Q60787 533 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 A4galtQ67BJ4 359 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cfap97Q6ZPR1 541 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rpl10Q6ZWV3 214 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nckap1lQ8K1X4 1134 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cyp2c70Q91W64 489 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dio3Q91ZI8 304 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Frmd4bQ920B0 1035 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nck1Q99M51 377 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cnbd2Q9D5U8 673 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AcadsbQ9DBL1 432 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cyp3a44Q9EQW4 504 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Wfdc1Q9ESH5 211 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fbxo17Q9QZM8 286 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CtsjQ9R014 334 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Chrna6Q9R0W9 494 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 RlfA2A7F4 1918 aa21.76■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CercamA3KGW5 592 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ceacam3E9Q6J4 706 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm16427J3QN52 483 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gnrh1P13562 90 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cd247P24161 164 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Grik2P39087 908 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 TgfbiP82198 683 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CamkvQ3UHL1 512 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm4981Q3ULJ8 291 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trim75Q3UWZ0 467 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Afg1lQ3V384 480 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Q8BP99 230 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pi4k2bQ8CBQ5 469 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 HnrnpabQ99020 285 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bpifa3Q9D9J8 232 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 P33monoxQ9DBN4 303 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc13a2Q9ES88 586 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Plxna4Q80UG2 1893 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm28363A0A087WQW2 129 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 4930402K13RikB1AW18 415 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Erich1E9PY43 332 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gria2P23819 883 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem165P52875 323 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Timm13P62075 95 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eps8Q08509 821 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sdf4Q61112 361 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zzz3Q6KAQ7 910 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gpr141Q7TQP0 305 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sgo2Q7TSY8 1164 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmcc2Q80W04 706 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pramel7Q810Y8 479 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 DglucyQ8BH86 617 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dpp9Q8BVG4 862 aa21.75■■□□□ 1.07
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sept11Q8C1B7 431 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.7 ms