Protein–RNA interactions for Protein: P52875

Tmem165, Transmembrane protein 165, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem165P52875 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Tmem165P52875 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Tmem165P52875 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tmem165P52875 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tmem165P52875 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Tmem165P52875 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmem165P52875 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Tmem165P52875 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmem165P52875 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmem165P52875 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tmem165P52875 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tmem165P52875 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmem165P52875 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tmem165P52875 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmem165P52875 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tmem165P52875 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmem165P52875 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmem165P52875 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmem165P52875 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmem165P52875 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmem165P52875 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmem165P52875 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmem165P52875 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmem165P52875 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmem165P52875 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmem165P52875 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmem165P52875 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tmem165P52875 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Tmem165P52875 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tmem165P52875 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmem165P52875 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmem165P52875 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmem165P52875 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmem165P52875 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tmem165P52875 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tmem165P52875 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tmem165P52875 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tmem165P52875 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmem165P52875 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Tmem165P52875 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tmem165P52875 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmem165P52875 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmem165P52875 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmem165P52875 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmem165P52875 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmem165P52875 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmem165P52875 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tmem165P52875 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmem165P52875 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmem165P52875 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tmem165P52875 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmem165P52875 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmem165P52875 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmem165P52875 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmem165P52875 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmem165P52875 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmem165P52875 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem165P52875 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmem165P52875 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmem165P52875 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmem165P52875 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmem165P52875 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmem165P52875 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmem165P52875 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmem165P52875 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmem165P52875 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmem165P52875 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem165P52875 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmem165P52875 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmem165P52875 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmem165P52875 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmem165P52875 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem165P52875 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmem165P52875 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmem165P52875 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmem165P52875 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem165P52875 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem165P52875 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem165P52875 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem165P52875 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem165P52875 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem165P52875 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem165P52875 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem165P52875 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem165P52875 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem165P52875 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem165P52875 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem165P52875 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem165P52875 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem165P52875 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem165P52875 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem165P52875 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem165P52875 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmem165P52875 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem165P52875 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem165P52875 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem165P52875 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem165P52875 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem165P52875 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem165P52875 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms