Protein–RNA interactions for Protein: Q920B0

Frmd4b, FERM domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4bQ920B0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,68■■■□□ 2,98
Frmd4bQ920B0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Frmd4bQ920B0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Frmd4bQ920B0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,61■■■□□ 2,65
Frmd4bQ920B0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
Frmd4bQ920B0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Frmd4bQ920B0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Frmd4bQ920B0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Frmd4bQ920B0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Frmd4bQ920B0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Frmd4bQ920B0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,13■■■□□ 2,41
Frmd4bQ920B0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Frmd4bQ920B0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Frmd4bQ920B0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,53■■■□□ 2,32
Frmd4bQ920B0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Frmd4bQ920B0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Frmd4bQ920B0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Frmd4bQ920B0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Frmd4bQ920B0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Frmd4bQ920B0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Frmd4bQ920B0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Frmd4bQ920B0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Frmd4bQ920B0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Frmd4bQ920B0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Frmd4bQ920B0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Frmd4bQ920B0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Frmd4bQ920B0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Frmd4bQ920B0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Frmd4bQ920B0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Frmd4bQ920B0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Frmd4bQ920B0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Frmd4bQ920B0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Frmd4bQ920B0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Frmd4bQ920B0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Frmd4bQ920B0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Frmd4bQ920B0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Frmd4bQ920B0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,25■■■□□ 2,11
Frmd4bQ920B0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Frmd4bQ920B0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Frmd4bQ920B0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Frmd4bQ920B0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Frmd4bQ920B0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Frmd4bQ920B0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Frmd4bQ920B0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Frmd4bQ920B0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Frmd4bQ920B0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
Frmd4bQ920B0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Frmd4bQ920B0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Frmd4bQ920B0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Frmd4bQ920B0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
Frmd4bQ920B0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Frmd4bQ920B0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Frmd4bQ920B0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Frmd4bQ920B0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Frmd4bQ920B0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Frmd4bQ920B0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Frmd4bQ920B0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Frmd4bQ920B0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Frmd4bQ920B0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Frmd4bQ920B0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Frmd4bQ920B0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Frmd4bQ920B0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Frmd4bQ920B0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Frmd4bQ920B0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Frmd4bQ920B0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Frmd4bQ920B0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Frmd4bQ920B0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Frmd4bQ920B0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,14■■□□□ 1,94
Frmd4bQ920B0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Frmd4bQ920B0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Frmd4bQ920B0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,92
Frmd4bQ920B0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Frmd4bQ920B0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Frmd4bQ920B0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Frmd4bQ920B0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Frmd4bQ920B0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Frmd4bQ920B0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Frmd4bQ920B0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Frmd4bQ920B0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Frmd4bQ920B0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Frmd4bQ920B0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Frmd4bQ920B0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Frmd4bQ920B0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Frmd4bQ920B0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Frmd4bQ920B0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Frmd4bQ920B0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Frmd4bQ920B0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Frmd4bQ920B0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,51■■□□□ 1,83
Frmd4bQ920B0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Frmd4bQ920B0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Frmd4bQ920B0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Frmd4bQ920B0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Frmd4bQ920B0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Frmd4bQ920B0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Frmd4bQ920B0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Frmd4bQ920B0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Frmd4bQ920B0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Frmd4bQ920B0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
Frmd4bQ920B0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Frmd4bQ920B0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms