RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 WASP42768 502 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
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SH3BP4-201ENST00000344528 OR14C36Q8NHC7 312 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM175Q9BSA9 504 aa16.28■□□□□ 0.2
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SH3BP4-201ENST00000344528 C11orf49Q9H6J7 331 aa16.28■□□□□ 0.2
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SH3BP4-201ENST00000344528 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa16.27■□□□□ 0.2
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SH3BP4-201ENST00000344528 ITPKAP23677 461 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD22Q5VYY1 191 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM110Q86TL2 294 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
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SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
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SH3BP4-201ENST00000344528 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGA1P56199 1179 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ALG11Q2TAA5 492 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 IRGCQ6NXR0 463 aa16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 STMN3Q9NZ72 180 aa16.27■□□□□ 0.19
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SH3BP4-201ENST00000344528 PCSK2P16519 638 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ACAP2Q15057 778 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SF1Q15637 639 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 AMIGO3Q86WK7 504 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ARNTL2Q8WYA1 636 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 CERS4Q9HA82 394 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 OGNP20774 298 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 PTGER3P43115 390 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 JAG1P78504 1218 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.26■□□□□ 0.193e-6■■■□□ 14.8
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SH3BP4-201ENST00000344528 SPESP1Q6UW49 350 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 DHDDSQ86SQ9 333 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 TMPRSS11BQ86T26 416 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SIAH1Q8IUQ4 282 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6V1HQ9UI12 483 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX10Q9Y5X0 201 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 AP3D1O14617 1153 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 STX11O75558 287 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 FECHP22830 423 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ASMTP46597 345 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 NEDD8Q15843 81 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 KCTD13Q8WZ19 329 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 YIPF1Q9Y548 306 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 NRP2O60462 931 aa16.26■□□□□ 0.19
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