RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341403.9

UBXN8-202, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-202ENST00000341403 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.53□□□□□ -0.88
UBXN8-202ENST00000341403 TEX13BQ9BXU2 312 aa9.53□□□□□ -0.88
UBXN8-202ENST00000341403 MAGEB5Q9BZ81 275 aa9.53□□□□□ -0.88
UBXN8-202ENST00000341403 BRINP2Q9C0B6 783 aa9.53□□□□□ -0.88
UBXN8-202ENST00000341403 CDT1Q9H211 546 aa9.53□□□□□ -0.88
UBXN8-202ENST00000341403 GORASP2Q9H8Y8 452 aa9.53□□□□□ -0.88
UBXN8-202ENST00000341403 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
UBXN8-202ENST00000341403 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
UBXN8-202ENST00000341403 FBXO28Q9NVF7 368 aa9.53□□□□□ -0.88
UBXN8-202ENST00000341403 ZNF358Q9NW07 568 aa9.53□□□□□ -0.88
UBXN8-202ENST00000341403 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
UBXN8-202ENST00000341403 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
UBXN8-202ENST00000341403 DNAJB9Q9UBS3 223 aa9.53□□□□□ -0.88
UBXN8-202ENST00000341403 TJP2Q9UDY2 1190 aa9.53□□□□□ -0.88
UBXN8-202ENST00000341403 COL1A2P08123 1366 aa9.52□□□□□ -0.88
UBXN8-202ENST00000341403 A0A1B0GTW7 788 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TNFRSF10AO00220 468 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 ARNTLO00327 626 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 PLOD2O00469 737 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CITO14578 2027 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 SCO2O43819 266 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 UPK1BO75841 260 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 MYO1DO94832 1006 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 MYCP01106 439 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CHRNA1P02708 482 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 ITGB3P05106 788 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 KRT8P05787 483 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 GNAO1P09471 354 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TFPTP0C1Z6 253 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CPB1P15086 417 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 MATN1P21941 496 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CHRNA5P30532 468 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 ETV6P41212 452 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CACNB3P54284 484 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 SOX10P56693 466 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 HERVK_113P63132 956 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CDC42EP1Q00587 391 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 IRF9Q00978 393 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 EMX2Q04743 252 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CHRNEQ04844 493 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 PRKCDQ05655 676 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CHRNB3Q05901 458 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 LAMC2Q13753 1193 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 KEAP1Q14145 624 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 RPS6KA2Q15349 733 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CTF1Q16619 201 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 KIF19Q2TAC6 998 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TMEM198Q66K66 360 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 SYCE2Q6PIF2 218 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CYP2R1Q6VVX0 501 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 SLCO6A1Q86UG4 719 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 P2RY8Q86VZ1 359 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 HORMAD1Q86X24 394 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 HIPK1Q86Z02 1210 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 ADHFE1Q8IWW8 467 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CRYBG2Q8N1P7 616 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 AMER2Q8N7J2 671 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 AGBL3Q8NEM8 1001 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 KCTD4Q8WVF5 259 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 HPS1Q92902 700 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TMEM125Q96AQ2 219 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 MFSD3Q96ES6 412 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TNIP3Q96KP6 325 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 ZNF560Q96MR9 790 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 FCRL5Q96RD9 977 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 NODALQ96S42 347 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CCDC32Q9BV29 185 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CEP44Q9C0F1 390 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 LHPPQ9H008 270 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 SIAEQ9HAT2 523 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 SCN3BQ9NY72 215 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 CORINQ9Y5Q5 1042 aa9.52□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 SYCE1LA8MT33 242 aa9.51□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 A8MT66 165 aa9.51□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 FXYD1O00168 92 aa9.51□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 HBP1O60381 514 aa9.51□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 RFPL2O75678 378 aa9.51□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 RGS20O76081 388 aa9.51□□□□□ -0.89
UBXN8-202ENST00000341403 PRR35P0CG20 571 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms