RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rin3P59729 980 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmprss9P69525 1065 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hbq1bQ3U0A6 142 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Akap14Q3V0I7 536 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dyrk2Q5U4C9 599 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc39a10Q6P5F6 833 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wfikkn2Q7TQN3 571 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Alkbh8Q80Y20 664 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stkld1Q80YS9 662 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gabra5Q8BHJ7 463 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ttc34Q8C0Q3 554 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ndufaf1Q9CWX2 328 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ebag9Q9D0V7 213 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 SarnpQ9D1J3 210 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gucy1a3Q9ERL9 691 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spag6Q9JLI7 507 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppm1dQ9QZ67 598 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cacna2d3Q9Z1L5 1091 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc194A0A140LIT1 234 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tcte1A6H639 498 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcna10B2RQA1 511 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r118E9Q1C1 853 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sgo2bJ3QMK1 1167 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 EsrraO08580 422 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpina3kP07759 418 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ifrd1P19182 449 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gja4P28235 333 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Uba1yP31254 1058 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ptpn5P54830 541 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 ErgP81270 486 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sox9Q04887 507 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Chi3l1Q61362 389 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc16a9Q7TM99 508 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 C8bQ8BH35 589 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 4921511C20RikQ8BVT7 469 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rab44Q8CB87 725 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 ProzQ9CQW3 399 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kctd4Q9D7X1 259 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nif3l1Q9EQ80 376 aa11.76□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trove2O08848 538 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 EomesO54839 707 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gucy2eP52785 1108 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tas2r16P59529 299 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rab10P61027 200 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gabrb3P63080 473 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snx21Q3UR97 363 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spag6Q3V0U9 509 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc9b2Q5BKR2 547 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppm1nQ8BGL1 404 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam129bQ8R1F1 749 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1325Q8VF43 315 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Golga5Q9QYE6 729 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tnfrsf14A0A1W2P7D5 276 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cldn4O35054 210 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Smad6O35182 495 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stam2O88811 523 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 P01740 135 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 H2-Eb1P04230 264 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 C4bpaP08607 469 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scrn3Q3TMH2 418 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rftn1Q6A0D4 554 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defb14Q7TNV9 67 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hamp2Q80T19 83 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 RbsnQ80Y56 783 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Serpinb9dQ8BMT0 377 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clptm1lQ8BXA5 539 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nmur2Q8BZ39 395 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 ApofQ91V80 315 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Homer3Q99JP6 356 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 HaghlQ9DB32 283 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 CasrQ9QY96 1079 aa11.75□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r14E9Q759 848 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr726E9Q8X3 321 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gdi1P50396 447 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr725Q05A45 321 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trafd1Q3UDK1 580 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Il10raQ61727 575 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pabpc2Q62029 628 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hfe2Q7TQ32 420 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 TwnkQ8CIW5 685 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zdhhc7Q91WU6 308 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tex46Q9CPU3 165 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 L3hypdhQ9CXA2 354 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bcl7aQ9CXE2 210 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ssu72Q9CY97 194 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sec13Q9D1M0 322 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mapk9Q9WTU6 423 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clcn5Q9WVD4 746 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Shroom3Q9QXN0 1986 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tekt5G5E8A8 557 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prl3b1P09586 222 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 PnpP23492 289 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sipa1P46062 1037 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tnfrsf4P47741 272 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cntn5P68500 1098 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myo1gQ5SUA5 1024 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 BadQ61337 204 aa11.74□□□□□ -0.53
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nt5eQ61503 576 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.8 ms