Protein–RNA interactions for Protein: O08848

Trove2, 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trove2O08848 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Trove2O08848 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trove2O08848 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trove2O08848 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Trove2O08848 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Trove2O08848 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Trove2O08848 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Trove2O08848 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Trove2O08848 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Trove2O08848 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Trove2O08848 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Trove2O08848 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Trove2O08848 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trove2O08848 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Trove2O08848 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Trove2O08848 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Trove2O08848 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Trove2O08848 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Trove2O08848 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trove2O08848 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Trove2O08848 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Trove2O08848 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Trove2O08848 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Trove2O08848 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Trove2O08848 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Trove2O08848 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trove2O08848 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trove2O08848 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Trove2O08848 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Trove2O08848 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Trove2O08848 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Trove2O08848 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trove2O08848 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trove2O08848 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trove2O08848 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trove2O08848 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Trove2O08848 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trove2O08848 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trove2O08848 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trove2O08848 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trove2O08848 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Trove2O08848 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trove2O08848 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trove2O08848 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Trove2O08848 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Trove2O08848 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trove2O08848 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trove2O08848 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trove2O08848 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trove2O08848 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Trove2O08848 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trove2O08848 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trove2O08848 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Trove2O08848 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trove2O08848 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trove2O08848 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Trove2O08848 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trove2O08848 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trove2O08848 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trove2O08848 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trove2O08848 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trove2O08848 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trove2O08848 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trove2O08848 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trove2O08848 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trove2O08848 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trove2O08848 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trove2O08848 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trove2O08848 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trove2O08848 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trove2O08848 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trove2O08848 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trove2O08848 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trove2O08848 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trove2O08848 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trove2O08848 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Trove2O08848 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trove2O08848 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trove2O08848 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trove2O08848 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trove2O08848 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trove2O08848 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trove2O08848 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trove2O08848 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trove2O08848 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trove2O08848 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trove2O08848 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trove2O08848 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trove2O08848 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trove2O08848 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trove2O08848 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trove2O08848 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trove2O08848 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trove2O08848 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trove2O08848 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trove2O08848 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trove2O08848 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Trove2O08848 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trove2O08848 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Trove2O08848 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms