Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
Cldn4O35054 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cldn4O35054 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cldn4O35054 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Cldn4O35054 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Cldn4O35054 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Cldn4O35054 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cldn4O35054 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cldn4O35054 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cldn4O35054 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cldn4O35054 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Cldn4O35054 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cldn4O35054 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cldn4O35054 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cldn4O35054 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cldn4O35054 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Cldn4O35054 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cldn4O35054 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cldn4O35054 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cldn4O35054 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Cldn4O35054 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cldn4O35054 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Cldn4O35054 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cldn4O35054 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cldn4O35054 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cldn4O35054 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Cldn4O35054 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Cldn4O35054 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cldn4O35054 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Cldn4O35054 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Cldn4O35054 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Cldn4O35054 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Cldn4O35054 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Cldn4O35054 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Cldn4O35054 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Cldn4O35054 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Cldn4O35054 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cldn4O35054 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cldn4O35054 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cldn4O35054 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cldn4O35054 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Cldn4O35054 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cldn4O35054 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cldn4O35054 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cldn4O35054 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Cldn4O35054 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cldn4O35054 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cldn4O35054 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cldn4O35054 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Cldn4O35054 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cldn4O35054 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cldn4O35054 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cldn4O35054 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cldn4O35054 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cldn4O35054 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
Cldn4O35054 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Cldn4O35054 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cldn4O35054 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cldn4O35054 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cldn4O35054 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cldn4O35054 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cldn4O35054 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Cldn4O35054 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cldn4O35054 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cldn4O35054 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cldn4O35054 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cldn4O35054 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cldn4O35054 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cldn4O35054 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cldn4O35054 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cldn4O35054 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cldn4O35054 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cldn4O35054 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Cldn4O35054 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cldn4O35054 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Cldn4O35054 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cldn4O35054 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cldn4O35054 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cldn4O35054 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cldn4O35054 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cldn4O35054 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cldn4O35054 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cldn4O35054 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cldn4O35054 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cldn4O35054 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cldn4O35054 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cldn4O35054 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cldn4O35054 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cldn4O35054 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cldn4O35054 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cldn4O35054 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cldn4O35054 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cldn4O35054 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Cldn4O35054 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cldn4O35054 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cldn4O35054 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cldn4O35054 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cldn4O35054 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cldn4O35054 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cldn4O35054 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms