Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cacna2d3Q9Z1L5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cacna2d3Q9Z1L5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cacna2d3Q9Z1L5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cacna2d3Q9Z1L5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cacna2d3Q9Z1L5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Cacna2d3Q9Z1L5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Cacna2d3Q9Z1L5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cacna2d3Q9Z1L5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cacna2d3Q9Z1L5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cacna2d3Q9Z1L5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Cacna2d3Q9Z1L5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Cacna2d3Q9Z1L5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cacna2d3Q9Z1L5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cacna2d3Q9Z1L5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cacna2d3Q9Z1L5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cacna2d3Q9Z1L5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cacna2d3Q9Z1L5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cacna2d3Q9Z1L5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cacna2d3Q9Z1L5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cacna2d3Q9Z1L5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cacna2d3Q9Z1L5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cacna2d3Q9Z1L5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cacna2d3Q9Z1L5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cacna2d3Q9Z1L5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cacna2d3Q9Z1L5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cacna2d3Q9Z1L5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms