Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Hbq1bQ3U0A6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Hbq1bQ3U0A6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Hbq1bQ3U0A6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Hbq1bQ3U0A6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Hbq1bQ3U0A6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Hbq1bQ3U0A6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Hbq1bQ3U0A6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Hbq1bQ3U0A6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Hbq1bQ3U0A6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Hbq1bQ3U0A6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Hbq1bQ3U0A6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Hbq1bQ3U0A6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Hbq1bQ3U0A6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Hbq1bQ3U0A6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Hbq1bQ3U0A6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Hbq1bQ3U0A6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Hbq1bQ3U0A6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Hbq1bQ3U0A6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Hbq1bQ3U0A6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Hbq1bQ3U0A6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Hbq1bQ3U0A6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Hbq1bQ3U0A6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Hbq1bQ3U0A6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Hbq1bQ3U0A6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Hbq1bQ3U0A6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Hbq1bQ3U0A6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Hbq1bQ3U0A6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Hbq1bQ3U0A6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Hbq1bQ3U0A6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hbq1bQ3U0A6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Hbq1bQ3U0A6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Hbq1bQ3U0A6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hbq1bQ3U0A6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hbq1bQ3U0A6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Hbq1bQ3U0A6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Hbq1bQ3U0A6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Hbq1bQ3U0A6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hbq1bQ3U0A6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hbq1bQ3U0A6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hbq1bQ3U0A6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hbq1bQ3U0A6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hbq1bQ3U0A6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Hbq1bQ3U0A6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hbq1bQ3U0A6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hbq1bQ3U0A6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Hbq1bQ3U0A6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hbq1bQ3U0A6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hbq1bQ3U0A6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hbq1bQ3U0A6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hbq1bQ3U0A6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Hbq1bQ3U0A6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hbq1bQ3U0A6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Hbq1bQ3U0A6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Hbq1bQ3U0A6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Hbq1bQ3U0A6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Hbq1bQ3U0A6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Hbq1bQ3U0A6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Hbq1bQ3U0A6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Hbq1bQ3U0A6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Hbq1bQ3U0A6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Hbq1bQ3U0A6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hbq1bQ3U0A6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hbq1bQ3U0A6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hbq1bQ3U0A6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Hbq1bQ3U0A6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hbq1bQ3U0A6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Hbq1bQ3U0A6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hbq1bQ3U0A6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hbq1bQ3U0A6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hbq1bQ3U0A6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Hbq1bQ3U0A6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Hbq1bQ3U0A6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Hbq1bQ3U0A6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hbq1bQ3U0A6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hbq1bQ3U0A6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hbq1bQ3U0A6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hbq1bQ3U0A6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hbq1bQ3U0A6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hbq1bQ3U0A6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Hbq1bQ3U0A6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hbq1bQ3U0A6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Hbq1bQ3U0A6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hbq1bQ3U0A6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hbq1bQ3U0A6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hbq1bQ3U0A6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hbq1bQ3U0A6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hbq1bQ3U0A6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hbq1bQ3U0A6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hbq1bQ3U0A6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hbq1bQ3U0A6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hbq1bQ3U0A6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hbq1bQ3U0A6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hbq1bQ3U0A6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hbq1bQ3U0A6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hbq1bQ3U0A6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Hbq1bQ3U0A6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hbq1bQ3U0A6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hbq1bQ3U0A6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hbq1bQ3U0A6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
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