Protein–RNA interactions for Protein: P61027

Rab10, Ras-related protein Rab-10, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab10P61027 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Rab10P61027 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rab10P61027 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rab10P61027 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rab10P61027 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rab10P61027 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rab10P61027 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Rab10P61027 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rab10P61027 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Rab10P61027 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rab10P61027 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Rab10P61027 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rab10P61027 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Rab10P61027 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Rab10P61027 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rab10P61027 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rab10P61027 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rab10P61027 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rab10P61027 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rab10P61027 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rab10P61027 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Rab10P61027 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rab10P61027 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rab10P61027 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Rab10P61027 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rab10P61027 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Rab10P61027 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Rab10P61027 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Rab10P61027 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rab10P61027 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rab10P61027 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rab10P61027 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rab10P61027 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rab10P61027 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Rab10P61027 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rab10P61027 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rab10P61027 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rab10P61027 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rab10P61027 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rab10P61027 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rab10P61027 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rab10P61027 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rab10P61027 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rab10P61027 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rab10P61027 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Rab10P61027 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab10P61027 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rab10P61027 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rab10P61027 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Rab10P61027 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rab10P61027 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rab10P61027 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rab10P61027 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rab10P61027 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rab10P61027 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rab10P61027 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rab10P61027 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rab10P61027 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rab10P61027 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rab10P61027 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Rab10P61027 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rab10P61027 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rab10P61027 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rab10P61027 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rab10P61027 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rab10P61027 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rab10P61027 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rab10P61027 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rab10P61027 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rab10P61027 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab10P61027 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab10P61027 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rab10P61027 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab10P61027 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab10P61027 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rab10P61027 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rab10P61027 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rab10P61027 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rab10P61027 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab10P61027 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rab10P61027 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab10P61027 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rab10P61027 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rab10P61027 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rab10P61027 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rab10P61027 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab10P61027 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab10P61027 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab10P61027 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rab10P61027 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rab10P61027 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rab10P61027 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab10P61027 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rab10P61027 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Rab10P61027 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rab10P61027 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rab10P61027 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rab10P61027 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rab10P61027 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rab10P61027 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms