Protein–RNA interactions for Protein: P09586

Prl3b1, Prolactin-3B1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3b1P09586 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,5■■■■□ 3,11
Prl3b1P09586 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Prl3b1P09586 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Prl3b1P09586 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,07■■■□□ 2,88
Prl3b1P09586 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,02■■■□□ 2,72
Prl3b1P09586 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Prl3b1P09586 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Prl3b1P09586 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Prl3b1P09586 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Prl3b1P09586 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Prl3b1P09586 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,93■■■□□ 2,54
Prl3b1P09586 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Prl3b1P09586 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Prl3b1P09586 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Prl3b1P09586 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Prl3b1P09586 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,6■■■□□ 2,49
Prl3b1P09586 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Prl3b1P09586 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,37■■■□□ 2,45
Prl3b1P09586 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Prl3b1P09586 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Prl3b1P09586 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Prl3b1P09586 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Prl3b1P09586 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Prl3b1P09586 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Prl3b1P09586 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Prl3b1P09586 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Prl3b1P09586 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Prl3b1P09586 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Prl3b1P09586 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Prl3b1P09586 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Prl3b1P09586 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
Prl3b1P09586 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Prl3b1P09586 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Prl3b1P09586 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Prl3b1P09586 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Prl3b1P09586 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Prl3b1P09586 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Prl3b1P09586 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Prl3b1P09586 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,1■■■□□ 2,25
Prl3b1P09586 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Prl3b1P09586 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Prl3b1P09586 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Prl3b1P09586 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Prl3b1P09586 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Prl3b1P09586 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Prl3b1P09586 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Prl3b1P09586 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Prl3b1P09586 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Prl3b1P09586 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Prl3b1P09586 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Prl3b1P09586 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Prl3b1P09586 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Prl3b1P09586 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Prl3b1P09586 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Prl3b1P09586 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Prl3b1P09586 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Prl3b1P09586 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Prl3b1P09586 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Prl3b1P09586 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Prl3b1P09586 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Prl3b1P09586 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Prl3b1P09586 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Prl3b1P09586 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Prl3b1P09586 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Prl3b1P09586 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Prl3b1P09586 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Prl3b1P09586 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Prl3b1P09586 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Prl3b1P09586 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Prl3b1P09586 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Prl3b1P09586 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Prl3b1P09586 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Prl3b1P09586 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Prl3b1P09586 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Prl3b1P09586 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Prl3b1P09586 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Prl3b1P09586 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Prl3b1P09586 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Prl3b1P09586 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Prl3b1P09586 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Prl3b1P09586 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Prl3b1P09586 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Prl3b1P09586 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Prl3b1P09586 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Prl3b1P09586 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Prl3b1P09586 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Prl3b1P09586 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Prl3b1P09586 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Prl3b1P09586 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Prl3b1P09586 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Prl3b1P09586 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Prl3b1P09586 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Prl3b1P09586 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Prl3b1P09586 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Prl3b1P09586 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Prl3b1P09586 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Prl3b1P09586 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,26■■□□□ 1,95
Prl3b1P09586 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Prl3b1P09586 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Prl3b1P09586 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85,6 ms