RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620466.4

ALMS1-208, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 2

Gene ALMS1, Length 6,720 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-208ENST00000620466 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 UNC5BQ8IZJ1 945 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 BCL2L14Q9BZR8 327 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 ATXN10Q9UBB4 475 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 NWD2Q9ULI1 1742 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 CHD4Q14839 1912 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 FFAR3O14843 346 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 GPR42O15529 346 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 OR6A2O95222 327 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 HLA-DQA2P01906 255 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 RPL9P32969 192 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 BRCC3P46736 316 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 TRIM32Q13049 653 aa8.35□□□□□ -1.07
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ALMS1-208ENST00000620466 DLG2Q15700 870 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 CRY1Q16526 586 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 METTL21CQ5VZV1 264 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 CLEC6AQ6EIG7 209 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF549Q6P9A3 640 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 SPATA22Q8NHS9 363 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 MCOLN3Q8TDD5 553 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 CIB1Q99828 191 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 STK39Q9UEW8 545 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 GNPTGQ9UJJ9 305 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 POMPQ9Y244 141 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 RPL38P63173 70 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 C1DQ13901 141 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 SPIDRQ14159 915 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 DPYSL2Q16555 572 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 FAM47BQ8NA70 645 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 SLC47A1Q96FL8 570 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 TWNKQ96RR1 684 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 C10orf71Q711Q0 1435 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 PTPRJQ12913 1337 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 MYH15Q9Y2K3 1946 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 FAM159BA6NKW6 160 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 MSCO60682 206 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 GNA13Q14344 377 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 NR1D2Q14995 579 aa8.35□□□□□ -1.07
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ALMS1-208ENST00000620466 FGD3Q5JSP0 725 aa8.35□□□□□ -1.07
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ALMS1-208ENST00000620466 CNTD1Q8N815 330 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 OR2T3Q8NH03 318 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 GPR152Q8TDT2 470 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 LPGAT1Q92604 370 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 ENTPD4Q9Y227 616 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 TRIM24O15164 1050 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 ITGAXP20702 1163 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 TTKP33981 857 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 CCR4P51679 360 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 PTPRNQ16849 979 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 GPR158Q5T848 1215 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 MACC1Q6ZN28 852 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 FAM81AQ8TBF8 368 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 LINGO1Q96FE5 620 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 TBX10O75333 385 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 LGR5O75473 907 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 SLC22A3O75751 556 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 C22orf31O95567 290 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 CST1P01037 141 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 CCNCP24863 283 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 RXRGP48443 463 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 TTPAP49638 278 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 NAA20P61599 178 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 SLC18A2Q05940 514 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 NEK10Q6ZWH5 1172 aa8.34□□□□□ -1.07
ALMS1-208ENST00000620466 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.34□□□□□ -1.07
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