RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FGGP02679 453 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HLA-DPA1P20036 260 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KELP23276 732 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CXCR5P32302 372 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIAA1024LP59773 190 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DPTQ07507 201 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BNIP3Q12983 259 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF542PQ5EBM4 170 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAET1GQ6H3X3 334 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF765Q7L2R6 523 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NRSN1Q8IZ57 195 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC35F6Q8N357 371 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RHBDD1Q8TEB9 315 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BTN2A2Q8WVV5 523 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC45Q96CN5 670 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AP2M1Q96CW1 435 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MRGPRX2Q96LB1 330 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PKD2L2Q9NZM6 624 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CD84Q9UIB8 345 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BTBD3Q9Y2F9 522 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF711Q9Y462 761 aa17.34■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa17.33■□□□□ 0.37
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHD6Q8TD26 2715 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RGSL1A5PLK6 1076 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 K7ESM1 405 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GIPC1O14908 333 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIAS2O75928 621 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC4A1P02730 911 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FGF1P05230 155 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PYGLP06737 847 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIRTP0C851 137 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 JUNDP17535 347 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DGKAP23743 735 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TEAD1P28347 426 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STIP1P31948 543 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM23P36406 574 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BLKP51451 505 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GDF10P55107 478 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPARDQ03181 441 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OASLQ15646 514 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC1A5Q15758 541 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDKN3Q16667 212 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LONRF2Q1L5Z9 754 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 P3H1Q32P28 736 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SIRPB2Q5JXA9 342 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C1orf54Q8WWF1 131 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR92Q96MX6 357 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDC6Q99741 560 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR63Q9BZJ6 419 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KLQ9UEF7 1012 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SHOC2Q9UQ13 582 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF148Q9UQR1 794 aa17.33■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CBFA2T3O75081 653 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GCATO75600 419 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACTN2P35609 894 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR1P46091 355 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPINT3P49223 89 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCNG2Q16589 344 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PARP6Q2NL67 630 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HS1BP3Q53T59 392 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ENPP7Q6UWV6 458 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RFLNAQ6ZTI6 216 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NLRP8Q86W28 1048 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HEATR4Q86WZ0 1026 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHACTR4Q8IZ21 702 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PELI3Q8N2H9 469 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC25A41Q8N5S1 370 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RTP4Q96DX8 246 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GORASP1Q9BQQ3 440 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FICDQ9BVA6 458 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC13A1Q9BZW2 595 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABCG8Q9H221 673 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRABDQ9H4I3 376 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAD18Q9NS91 495 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HACD3Q9P035 362 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FTSJ1Q9UET6 329 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PYCARDQ9ULZ3 195 aa17.32■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa17.31■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEMP2A6NFY4 417 aa17.31■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 USP27XA6NNY8 438 aa17.31■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RASGRP1O95267 797 aa17.31■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IFNB1P01574 187 aa17.31■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALPPL2P10696 532 aa17.31■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHRNA4P43681 627 aa17.31■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDK3Q00526 305 aa17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms