RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 FNIP2Q9P278 1114 aa6.31□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 CD300AQ9UGN4 299 aa6.31□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 EBF1Q9UH73 591 aa6.31□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.31□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 APPL1Q9UKG1 709 aa6.31□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.3□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.3□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 CITO14578 2027 aa6.3□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 MFSD11O43934 449 aa6.3□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.3□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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SGIP1-201ENST00000237247 GPC2Q8N158 579 aa6.3□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SGIP1-201ENST00000237247 UBA3Q8TBC4 463 aa6.3□□□□□ -1.4
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