RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061209.6

Ccdc71-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,092 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nrif1Q923B3 828 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adam21Q9JI76 729 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc13D3YV10 709 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm10715J3QP74 227 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CtssO70370 340 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Adh5P28474 374 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pou2f3P31362 431 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Snx21Q3UR97 363 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 ScinQ60604 715 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc41a1Q8BJA2 512 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 4932411N23RikQ8C0S0 470 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ccdc187Q8C5V8 958 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp449Q8CB76 518 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tram1l1Q8QZR0 363 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ndufab1Q9CR21 156 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gpihbp1Q9D1N2 228 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vsig1Q9D2J4 407 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mrps33Q9D2R8 106 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Alms1Q8K4E0 3251 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Baz2aQ91YE5 1889 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp811A0A0J9YU71 552 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Klhl32A2AJX0 620 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 P01673 111 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ap1s1P61967 158 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Trim43bP86448 445 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lrrc8bQ5DU41 803 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 MelkQ61846 643 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hs3st2Q673U1 367 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ssxb5Q6XAS2 159 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr834Q7TRG8 312 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Elmo2Q8BHL5 732 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ttc34Q8C0Q3 554 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Spp2Q8K1I3 203 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Fam129bQ8R1F1 749 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp773Q9CZ29 471 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gpr63Q9EQQ3 425 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pard6bQ9JK83 371 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ppm1dQ9QZ67 598 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sgk2Q9QZS5 367 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Crlf3Q9Z2L7 442 aa13.07□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pcm1Q9R0L6 2025 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Eml5Q8BQM8 1977 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 2310061I04RikB8JJ69 315 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Aldh1a7O35945 501 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 HdcP23738 662 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dsc3P55850 896 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Atp5bP56480 529 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Polr3bP59470 1133 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hbq1bQ3U0A6 142 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mettl17Q3U2U7 461 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slfn4Q3UV66 602 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Pde1aQ61481 565 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Plk4Q64702 925 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slc16a9Q7TM99 508 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 C8bQ8BH35 589 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gabra5Q8BHJ7 463 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Lrrc17Q9CXD9 443 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CpqQ9WVJ3 470 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 DldO08749 509 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Hnf1bP27889 558 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Htr7P32304 448 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mtf2Q02395 593 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zbtb16Q3UQ17 673 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Cspg5Q71M36 566 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Atp2c1Q80XR2 918 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp438Q8BFX2 798 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sfr1Q8BP27 319 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Btbd9Q8C726 612 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tmem259Q8CIV2 574 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mrpl38Q8K2M0 380 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Znf426Q8R1D1 550 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn1r214Q8R279 367 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 VitQ8VHI5 650 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Camk1Q91YS8 374 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 PdiltQ9DAN1 588 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rnf4Q9QZS2 194 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 GghQ9Z0L8 317 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Net1Q9Z206 595 aa13.06□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Tnfrsf14A0A1W2P7D5 276 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Mgat4eA6H684 439 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gbp11A9YVJ5 442 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Kcna10B2RQA1 511 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn1r55E9Q8I6 310 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Gm21738J3QP72 227 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 CryaaP24622 196 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Rspry1Q8BVR6 576 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 TmieQ8K467 153 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Treml1Q8K558 317 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Ggt7Q99JP7 662 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nt5cQ9JM14 200 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Dbn1Q9QXS6 706 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Nufip1Q9QXX8 484 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Olfr566A0A1B0GST0 319 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Slfn8B1ARD8 910 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Smok3aC0HKC8 504 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Smok3bC0HKC9 504 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Zfp169E9Q3R6 731 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Vmn1r76F8VQ63 324 aa13.05□□□□□ -0.32
Ccdc71-201ENSMUST00000061209 Sgo2bJ3QMK1 1167 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.5 ms