Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1N2

Gpihbp1, Glycosylphosphatidylinositol-anchored high density lipoprotein-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpihbp1Q9D1N2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Gpihbp1Q9D1N2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Gpihbp1Q9D1N2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Gpihbp1Q9D1N2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Gpihbp1Q9D1N2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Gpihbp1Q9D1N2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Gpihbp1Q9D1N2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Gpihbp1Q9D1N2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Gpihbp1Q9D1N2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Gpihbp1Q9D1N2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gpihbp1Q9D1N2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gpihbp1Q9D1N2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Gpihbp1Q9D1N2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gpihbp1Q9D1N2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gpihbp1Q9D1N2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gpihbp1Q9D1N2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gpihbp1Q9D1N2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Gpihbp1Q9D1N2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Gpihbp1Q9D1N2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Gpihbp1Q9D1N2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Gpihbp1Q9D1N2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gpihbp1Q9D1N2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gpihbp1Q9D1N2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gpihbp1Q9D1N2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gpihbp1Q9D1N2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gpihbp1Q9D1N2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Gpihbp1Q9D1N2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gpihbp1Q9D1N2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Gpihbp1Q9D1N2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gpihbp1Q9D1N2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Gpihbp1Q9D1N2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Gpihbp1Q9D1N2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gpihbp1Q9D1N2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gpihbp1Q9D1N2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Gpihbp1Q9D1N2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Gpihbp1Q9D1N2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Gpihbp1Q9D1N2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gpihbp1Q9D1N2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gpihbp1Q9D1N2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gpihbp1Q9D1N2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gpihbp1Q9D1N2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Gpihbp1Q9D1N2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gpihbp1Q9D1N2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gpihbp1Q9D1N2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gpihbp1Q9D1N2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gpihbp1Q9D1N2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Gpihbp1Q9D1N2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gpihbp1Q9D1N2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gpihbp1Q9D1N2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gpihbp1Q9D1N2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gpihbp1Q9D1N2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gpihbp1Q9D1N2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gpihbp1Q9D1N2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gpihbp1Q9D1N2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gpihbp1Q9D1N2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gpihbp1Q9D1N2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gpihbp1Q9D1N2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gpihbp1Q9D1N2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gpihbp1Q9D1N2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gpihbp1Q9D1N2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gpihbp1Q9D1N2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gpihbp1Q9D1N2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gpihbp1Q9D1N2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gpihbp1Q9D1N2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gpihbp1Q9D1N2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gpihbp1Q9D1N2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gpihbp1Q9D1N2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gpihbp1Q9D1N2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Gpihbp1Q9D1N2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gpihbp1Q9D1N2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gpihbp1Q9D1N2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gpihbp1Q9D1N2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gpihbp1Q9D1N2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gpihbp1Q9D1N2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gpihbp1Q9D1N2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gpihbp1Q9D1N2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gpihbp1Q9D1N2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gpihbp1Q9D1N2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gpihbp1Q9D1N2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gpihbp1Q9D1N2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gpihbp1Q9D1N2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gpihbp1Q9D1N2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gpihbp1Q9D1N2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gpihbp1Q9D1N2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gpihbp1Q9D1N2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpihbp1Q9D1N2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gpihbp1Q9D1N2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gpihbp1Q9D1N2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gpihbp1Q9D1N2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gpihbp1Q9D1N2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gpihbp1Q9D1N2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gpihbp1Q9D1N2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gpihbp1Q9D1N2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gpihbp1Q9D1N2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gpihbp1Q9D1N2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Gpihbp1Q9D1N2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gpihbp1Q9D1N2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gpihbp1Q9D1N2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gpihbp1Q9D1N2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gpihbp1Q9D1N2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms