Protein–RNA interactions for Protein: P24622

Cryaa, Alpha-crystallin A chain, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CryaaP24622 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
CryaaP24622 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CryaaP24622 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CryaaP24622 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CryaaP24622 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CryaaP24622 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CryaaP24622 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CryaaP24622 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CryaaP24622 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
CryaaP24622 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CryaaP24622 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CryaaP24622 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CryaaP24622 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CryaaP24622 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CryaaP24622 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CryaaP24622 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CryaaP24622 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CryaaP24622 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CryaaP24622 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CryaaP24622 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CryaaP24622 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CryaaP24622 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CryaaP24622 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CryaaP24622 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CryaaP24622 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CryaaP24622 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CryaaP24622 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CryaaP24622 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CryaaP24622 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CryaaP24622 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CryaaP24622 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CryaaP24622 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CryaaP24622 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CryaaP24622 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CryaaP24622 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CryaaP24622 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CryaaP24622 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CryaaP24622 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CryaaP24622 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CryaaP24622 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CryaaP24622 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CryaaP24622 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CryaaP24622 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CryaaP24622 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CryaaP24622 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CryaaP24622 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CryaaP24622 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CryaaP24622 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CryaaP24622 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CryaaP24622 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CryaaP24622 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CryaaP24622 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CryaaP24622 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CryaaP24622 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CryaaP24622 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CryaaP24622 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CryaaP24622 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CryaaP24622 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CryaaP24622 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CryaaP24622 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CryaaP24622 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CryaaP24622 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CryaaP24622 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CryaaP24622 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CryaaP24622 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CryaaP24622 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CryaaP24622 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CryaaP24622 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CryaaP24622 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CryaaP24622 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CryaaP24622 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CryaaP24622 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CryaaP24622 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CryaaP24622 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CryaaP24622 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CryaaP24622 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CryaaP24622 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CryaaP24622 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CryaaP24622 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CryaaP24622 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CryaaP24622 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CryaaP24622 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CryaaP24622 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CryaaP24622 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CryaaP24622 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CryaaP24622 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CryaaP24622 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CryaaP24622 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CryaaP24622 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CryaaP24622 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CryaaP24622 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CryaaP24622 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CryaaP24622 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CryaaP24622 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CryaaP24622 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CryaaP24622 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CryaaP24622 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CryaaP24622 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CryaaP24622 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CryaaP24622 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms