RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000035721.13

Prpf18-201, Transcript of Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prpf18, Length 3,522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18-201ENSMUST00000035721 CercamA3KGW5 592 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Spocd1B1ASB6 936 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Cilp2D3Z7H8 1162 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Tsc22d2E9Q7M2 769 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Vmn2r2L7N2E9 908 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Grcc10O35127 126 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 AmbnO55189 407 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Pou3f2P31360 445 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Eif3eP60229 445 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Abce1P61222 599 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Txnl4aP83877 142 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Bop1P97452 732 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Dok7Q18PE0 504 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Adora2aQ60613 410 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Kcna5Q61762 602 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Pon3Q62087 354 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Ahcyl2Q68FL4 613 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Atp11bQ6DFW5 1175 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Nomo1Q6GQT9 1214 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Herc4Q6PAV2 1057 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Mtch2Q791V5 303 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Pcdh8Q7TSK3 1070 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Nucks1Q80XU3 234 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Nyap2Q8BM65 682 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Prkaa2Q8BRK8 552 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 IntS13Q8QZV7 732 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Snapc2Q91XA5 359 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Tpra1Q99MU1 369 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Tmem9Q9CR23 183 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Rabl3Q9D4V7 236 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Serpina9Q9D7D2 418 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Psmg1Q9JK23 289 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Col3a1P08121 1464 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Gm2030D3Z7C4 212 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Olfr1410E9PYK6 323 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Fignl2J3QK54 644 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Gm16427J3QN52 483 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Rpp30O88796 268 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Gpr3P35413 330 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Gdf6P43028 454 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Pdcd5P56812 126 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 HmgcrQ01237 887 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Jmjd8Q3TA59 316 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Ceacam5Q3UKK2 947 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Cntn2Q61330 1040 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Cfap161Q6P8Y0 303 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Tbx10Q810F8 385 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Tex13c3Q810P0 219 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Cpeb2Q812E0 521 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Micu2Q8CD10 432 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Slc49a3Q8CE47 516 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Emid1Q91VF5 444 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Plpp7Q91WB2 271 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Tcaf2Q921K8 919 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Snx29Q9D3S3 818 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Q9DAQ4 598 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Plscr2Q9DCW2 307 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Rab13Q9DD03 202 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Rassf7Q9DD19 359 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Tmem47Q9JJG6 181 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 HcstQ9QUJ0 79 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Limd1Q9QXD8 668 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Smok2aQ9QYZ6 504 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Padi4Q9Z183 666 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Gm10250G3X9L6 160 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Cldn4O35054 210 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Alppl2P24823 529 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Ndst2P52850 883 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Sesn1P58006 492 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Rtkn2Q14B46 604 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Slc24a2Q14BI1 711 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 SctrQ5FWI2 447 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Rsad1Q5SUV1 442 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Ctnna2Q61301 953 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Gpalpp1Q69ZC8 346 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Atg16l2Q6KAU8 623 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Wfikkn2Q7TQN3 571 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Depdc1bQ8BH88 529 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Leng9Q8BTN6 485 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Pak4Q8BTW9 593 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Slc9a9Q8BZ00 644 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Trub1Q8C0D0 338 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Yipf4Q8C407 246 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Pom121Q8K3Z9 1200 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Adam32Q8K410 754 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Cts3Q91ZD5 332 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 MpstQ99J99 297 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Lrrc57Q9D1G5 239 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Atp5hQ9DCX2 161 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Gal3st1Q9JHE4 423 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 SqorQ9R112 450 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Mapk9Q9WTU6 423 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 PrebQ9WUQ2 417 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 AireQ9Z0E3 552 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Eif2s3xQ9Z0N1 472 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 Eif2s3yQ9Z0N2 472 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 MycsQ9Z304 431 aa8.29□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 PfasQ5SUR0 1337 aa8.28□□□□□ -1.08
Prpf18-201ENSMUST00000035721 TomtA1Y9I9 258 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8.4 ms