Protein–RNA interactions for Protein: O35127

Grcc10, Protein C10, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grcc10O35127 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Grcc10O35127 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grcc10O35127 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Grcc10O35127 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Grcc10O35127 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Grcc10O35127 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grcc10O35127 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grcc10O35127 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grcc10O35127 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grcc10O35127 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grcc10O35127 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grcc10O35127 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grcc10O35127 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grcc10O35127 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grcc10O35127 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grcc10O35127 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grcc10O35127 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Grcc10O35127 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Grcc10O35127 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grcc10O35127 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grcc10O35127 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grcc10O35127 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grcc10O35127 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grcc10O35127 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grcc10O35127 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grcc10O35127 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grcc10O35127 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grcc10O35127 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grcc10O35127 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grcc10O35127 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grcc10O35127 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grcc10O35127 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grcc10O35127 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grcc10O35127 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grcc10O35127 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Grcc10O35127 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grcc10O35127 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Grcc10O35127 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grcc10O35127 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grcc10O35127 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Grcc10O35127 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grcc10O35127 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grcc10O35127 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grcc10O35127 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grcc10O35127 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grcc10O35127 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grcc10O35127 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grcc10O35127 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grcc10O35127 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Grcc10O35127 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grcc10O35127 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grcc10O35127 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grcc10O35127 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grcc10O35127 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grcc10O35127 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grcc10O35127 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grcc10O35127 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grcc10O35127 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grcc10O35127 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Grcc10O35127 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grcc10O35127 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grcc10O35127 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grcc10O35127 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grcc10O35127 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grcc10O35127 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grcc10O35127 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grcc10O35127 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grcc10O35127 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grcc10O35127 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grcc10O35127 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grcc10O35127 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Grcc10O35127 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Grcc10O35127 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Grcc10O35127 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Grcc10O35127 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grcc10O35127 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grcc10O35127 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grcc10O35127 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grcc10O35127 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grcc10O35127 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grcc10O35127 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grcc10O35127 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grcc10O35127 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Grcc10O35127 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grcc10O35127 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Grcc10O35127 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grcc10O35127 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grcc10O35127 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Grcc10O35127 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grcc10O35127 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Grcc10O35127 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Grcc10O35127 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Grcc10O35127 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Grcc10O35127 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grcc10O35127 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Grcc10O35127 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grcc10O35127 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grcc10O35127 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grcc10O35127 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grcc10O35127 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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