Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Ctnna2Q61301 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ctnna2Q61301 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ctnna2Q61301 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ctnna2Q61301 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ctnna2Q61301 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Ctnna2Q61301 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ctnna2Q61301 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ctnna2Q61301 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Ctnna2Q61301 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ctnna2Q61301 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ctnna2Q61301 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ctnna2Q61301 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Ctnna2Q61301 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Ctnna2Q61301 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ctnna2Q61301 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ctnna2Q61301 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ctnna2Q61301 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ctnna2Q61301 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ctnna2Q61301 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ctnna2Q61301 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Ctnna2Q61301 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ctnna2Q61301 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Ctnna2Q61301 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ctnna2Q61301 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ctnna2Q61301 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Ctnna2Q61301 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ctnna2Q61301 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ctnna2Q61301 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ctnna2Q61301 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ctnna2Q61301 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ctnna2Q61301 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ctnna2Q61301 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ctnna2Q61301 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ctnna2Q61301 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ctnna2Q61301 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ctnna2Q61301 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Ctnna2Q61301 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ctnna2Q61301 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ctnna2Q61301 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ctnna2Q61301 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ctnna2Q61301 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ctnna2Q61301 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ctnna2Q61301 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ctnna2Q61301 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Ctnna2Q61301 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ctnna2Q61301 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ctnna2Q61301 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ctnna2Q61301 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Ctnna2Q61301 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ctnna2Q61301 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ctnna2Q61301 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ctnna2Q61301 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ctnna2Q61301 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ctnna2Q61301 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ctnna2Q61301 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ctnna2Q61301 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Ctnna2Q61301 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ctnna2Q61301 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Ctnna2Q61301 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ctnna2Q61301 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ctnna2Q61301 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ctnna2Q61301 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ctnna2Q61301 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ctnna2Q61301 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ctnna2Q61301 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ctnna2Q61301 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ctnna2Q61301 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ctnna2Q61301 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ctnna2Q61301 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ctnna2Q61301 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ctnna2Q61301 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ctnna2Q61301 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ctnna2Q61301 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ctnna2Q61301 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ctnna2Q61301 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ctnna2Q61301 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ctnna2Q61301 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ctnna2Q61301 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ctnna2Q61301 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ctnna2Q61301 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ctnna2Q61301 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ctnna2Q61301 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ctnna2Q61301 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ctnna2Q61301 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ctnna2Q61301 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ctnna2Q61301 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ctnna2Q61301 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ctnna2Q61301 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ctnna2Q61301 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ctnna2Q61301 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ctnna2Q61301 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ctnna2Q61301 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ctnna2Q61301 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ctnna2Q61301 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ctnna2Q61301 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ctnna2Q61301 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ctnna2Q61301 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ctnna2Q61301 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ctnna2Q61301 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms