Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
Cts3Q91ZD5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cts3Q91ZD5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cts3Q91ZD5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Cts3Q91ZD5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Cts3Q91ZD5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Cts3Q91ZD5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cts3Q91ZD5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cts3Q91ZD5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cts3Q91ZD5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cts3Q91ZD5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cts3Q91ZD5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Cts3Q91ZD5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cts3Q91ZD5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cts3Q91ZD5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cts3Q91ZD5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cts3Q91ZD5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Cts3Q91ZD5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cts3Q91ZD5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Cts3Q91ZD5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Cts3Q91ZD5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cts3Q91ZD5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Cts3Q91ZD5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cts3Q91ZD5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cts3Q91ZD5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Cts3Q91ZD5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Cts3Q91ZD5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Cts3Q91ZD5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cts3Q91ZD5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cts3Q91ZD5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cts3Q91ZD5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cts3Q91ZD5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Cts3Q91ZD5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Cts3Q91ZD5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cts3Q91ZD5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cts3Q91ZD5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Cts3Q91ZD5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cts3Q91ZD5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cts3Q91ZD5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cts3Q91ZD5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cts3Q91ZD5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cts3Q91ZD5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cts3Q91ZD5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cts3Q91ZD5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cts3Q91ZD5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Cts3Q91ZD5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cts3Q91ZD5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cts3Q91ZD5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cts3Q91ZD5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cts3Q91ZD5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cts3Q91ZD5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cts3Q91ZD5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Cts3Q91ZD5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cts3Q91ZD5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cts3Q91ZD5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cts3Q91ZD5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cts3Q91ZD5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cts3Q91ZD5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cts3Q91ZD5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Cts3Q91ZD5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cts3Q91ZD5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cts3Q91ZD5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cts3Q91ZD5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cts3Q91ZD5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cts3Q91ZD5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Cts3Q91ZD5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cts3Q91ZD5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cts3Q91ZD5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cts3Q91ZD5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cts3Q91ZD5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cts3Q91ZD5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cts3Q91ZD5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cts3Q91ZD5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cts3Q91ZD5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cts3Q91ZD5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cts3Q91ZD5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cts3Q91ZD5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cts3Q91ZD5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cts3Q91ZD5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cts3Q91ZD5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cts3Q91ZD5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Cts3Q91ZD5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Cts3Q91ZD5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cts3Q91ZD5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cts3Q91ZD5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cts3Q91ZD5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cts3Q91ZD5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cts3Q91ZD5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cts3Q91ZD5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cts3Q91ZD5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cts3Q91ZD5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cts3Q91ZD5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cts3Q91ZD5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cts3Q91ZD5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cts3Q91ZD5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cts3Q91ZD5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Cts3Q91ZD5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cts3Q91ZD5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cts3Q91ZD5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cts3Q91ZD5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms