Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z183

Padi4, Protein-arginine deiminase type-4, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi4Q9Z183 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Padi4Q9Z183 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Padi4Q9Z183 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Padi4Q9Z183 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Padi4Q9Z183 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Padi4Q9Z183 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Padi4Q9Z183 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Padi4Q9Z183 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Padi4Q9Z183 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Padi4Q9Z183 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Padi4Q9Z183 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Padi4Q9Z183 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Padi4Q9Z183 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Padi4Q9Z183 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Padi4Q9Z183 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Padi4Q9Z183 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Padi4Q9Z183 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Padi4Q9Z183 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Padi4Q9Z183 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Padi4Q9Z183 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Padi4Q9Z183 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Padi4Q9Z183 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Padi4Q9Z183 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Padi4Q9Z183 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Padi4Q9Z183 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Padi4Q9Z183 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Padi4Q9Z183 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Padi4Q9Z183 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Padi4Q9Z183 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Padi4Q9Z183 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Padi4Q9Z183 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Padi4Q9Z183 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Padi4Q9Z183 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Padi4Q9Z183 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Padi4Q9Z183 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Padi4Q9Z183 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Padi4Q9Z183 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Padi4Q9Z183 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Padi4Q9Z183 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Padi4Q9Z183 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Padi4Q9Z183 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Padi4Q9Z183 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Padi4Q9Z183 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Padi4Q9Z183 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Padi4Q9Z183 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Padi4Q9Z183 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Padi4Q9Z183 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Padi4Q9Z183 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Padi4Q9Z183 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Padi4Q9Z183 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Padi4Q9Z183 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Padi4Q9Z183 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Padi4Q9Z183 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Padi4Q9Z183 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Padi4Q9Z183 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Padi4Q9Z183 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Padi4Q9Z183 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Padi4Q9Z183 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Padi4Q9Z183 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Padi4Q9Z183 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Padi4Q9Z183 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Padi4Q9Z183 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Padi4Q9Z183 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Padi4Q9Z183 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Padi4Q9Z183 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Padi4Q9Z183 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Padi4Q9Z183 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Padi4Q9Z183 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Padi4Q9Z183 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Padi4Q9Z183 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Padi4Q9Z183 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Padi4Q9Z183 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Padi4Q9Z183 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Padi4Q9Z183 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Padi4Q9Z183 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Padi4Q9Z183 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Padi4Q9Z183 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Padi4Q9Z183 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Padi4Q9Z183 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Padi4Q9Z183 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Padi4Q9Z183 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Padi4Q9Z183 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Padi4Q9Z183 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Padi4Q9Z183 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Padi4Q9Z183 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Padi4Q9Z183 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Padi4Q9Z183 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Padi4Q9Z183 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Padi4Q9Z183 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Padi4Q9Z183 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Padi4Q9Z183 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Padi4Q9Z183 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Padi4Q9Z183 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Padi4Q9Z183 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Padi4Q9Z183 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Padi4Q9Z183 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Padi4Q9Z183 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Padi4Q9Z183 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Padi4Q9Z183 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Padi4Q9Z183 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169 ms