Protein–RNA interactions for Protein: P83877

Txnl4a, Thioredoxin-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnl4aP83877 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Txnl4aP83877 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Txnl4aP83877 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Txnl4aP83877 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Txnl4aP83877 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Txnl4aP83877 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Txnl4aP83877 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Txnl4aP83877 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Txnl4aP83877 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Txnl4aP83877 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Txnl4aP83877 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Txnl4aP83877 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Txnl4aP83877 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Txnl4aP83877 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Txnl4aP83877 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Txnl4aP83877 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Txnl4aP83877 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Txnl4aP83877 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Txnl4aP83877 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Txnl4aP83877 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Txnl4aP83877 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Txnl4aP83877 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Txnl4aP83877 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Txnl4aP83877 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Txnl4aP83877 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Txnl4aP83877 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Txnl4aP83877 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Txnl4aP83877 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Txnl4aP83877 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Txnl4aP83877 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Txnl4aP83877 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Txnl4aP83877 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Txnl4aP83877 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Txnl4aP83877 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Txnl4aP83877 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Txnl4aP83877 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Txnl4aP83877 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Txnl4aP83877 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Txnl4aP83877 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Txnl4aP83877 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Txnl4aP83877 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Txnl4aP83877 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Txnl4aP83877 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Txnl4aP83877 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Txnl4aP83877 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Txnl4aP83877 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Txnl4aP83877 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Txnl4aP83877 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Txnl4aP83877 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Txnl4aP83877 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Txnl4aP83877 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Txnl4aP83877 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Txnl4aP83877 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Txnl4aP83877 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Txnl4aP83877 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Txnl4aP83877 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Txnl4aP83877 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Txnl4aP83877 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Txnl4aP83877 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Txnl4aP83877 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Txnl4aP83877 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Txnl4aP83877 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Txnl4aP83877 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Txnl4aP83877 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Txnl4aP83877 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Txnl4aP83877 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Txnl4aP83877 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Txnl4aP83877 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Txnl4aP83877 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Txnl4aP83877 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Txnl4aP83877 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Txnl4aP83877 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Txnl4aP83877 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Txnl4aP83877 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Txnl4aP83877 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Txnl4aP83877 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Txnl4aP83877 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Txnl4aP83877 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Txnl4aP83877 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Txnl4aP83877 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Txnl4aP83877 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Txnl4aP83877 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Txnl4aP83877 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Txnl4aP83877 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Txnl4aP83877 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Txnl4aP83877 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Txnl4aP83877 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Txnl4aP83877 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Txnl4aP83877 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Txnl4aP83877 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Txnl4aP83877 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Txnl4aP83877 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Txnl4aP83877 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Txnl4aP83877 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Txnl4aP83877 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Txnl4aP83877 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Txnl4aP83877 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Txnl4aP83877 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Txnl4aP83877 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Txnl4aP83877 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms