RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751		H7C0C1	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PALM	O75781	387 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ARL2	P36404	184 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ATP5O	P48047	213 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DEFA6	Q01524	100 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PON2	Q15165	354 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CBX8	Q9HC52	389 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ARID1A	O14497	2285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TDP2	O95551	362 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ASMTL	O95671	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PTGS1	P23219	599 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	STAR	P49675	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MC1R	Q01726	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TAF5	Q15542	800 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	VPS11	Q9H270	941 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751		H7C2Y5	167 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RIPK2	O43353	540 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SOCS5	O75159	536 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SCGN	O76038	276 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SPAM1	P38567	509 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ACADVL	P49748	655 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ROR1	Q01973	937 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	OSMR	Q99650	979 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DEC1	Q9P2X7	70 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SLC7A4	O43246	635 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RAD51C	O43502	376 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CXCL14	O95715	111 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ATF6	P18850	670 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HNF1A	P20823	631 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	F8A1	P23610	371 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PRKCI	P41743	596 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	C21orf59	P57076	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TLE2	Q04725	743 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MPP7	Q5T2T1	576 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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