RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, human

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANKRD28-215	ENST00000624145	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	WASF3	Q9UPY6	502 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.06	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145		A0A0G2JPF8	293 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	HYKK	A2RU49	373 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	FFAR3	O14843	346 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	GPR42	O15529	346 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	GMFG	O60234	142 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	OTC	P00480	354 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	PROC	P04070	461 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	ICAM1	P05362	532 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	4.05	□□□□□ -1.76	7e-8	■■■□□ 17
ANKRD28-215	ENST00000624145	NR4A1	P22736	598 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	DPYS	Q14117	519 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	CRY2	Q49AN0	593 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	RAB43	Q86YS6	212 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	DNASE1L2	Q92874	299 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	IFT52	Q9Y366	437 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	PZP	P20742	1482 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145		A0A087X0B3	334 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	OR2AT4	A6NND4	320 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	HCN1	O60741	890 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	CHRNA5	P30532	468 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	NR1H2	P55055	460 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCZ1B	P86790	482 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	SP140	Q13342	867 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	TLR1	Q15399	786 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145		Q4G0T1	1027 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	SBK1	Q52WX2	424 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	XKR4	Q5GH76	650 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	OSMR	Q99650	979 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	PSMD9	O00233	223 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	PLK4	O00444	970 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	E2F3	O00716	465 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	RFXANK	O14593	260 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	PDCD5	O14737	125 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	UGT2B11	O75310	529 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	PSMG1	O95456	288 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	IL1B	P01584	269 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	GYPC	P04921	128 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	HOXC6	P09630	235 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	HGF	P14210	728 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZNF823	P16415	610 aa		4.05	□□□□□ -1.76
ANKRD28-215	ENST00000624145	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76

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