RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 POM121L1PQ3SYA9 428 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CNSTQ6PJW8 725 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 GPR180Q86V85 440 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 MARK4Q96L34 752 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 OSBPL6Q9BZF3 934 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 BRD9Q9H8M2 597 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ZFP14Q9HCL3 533 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 URADA6NGE7 173 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 OR4Q2P0C623 313 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC35G4P0C7Q5 338 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 IDO1P14902 403 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 TNK2Q07912 1038 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 INAQ16352 499 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 GSTA3Q16772 222 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CFAP52Q8N1V2 620 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 NETO2Q8NC67 525 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 DEPDC7Q96QD5 511 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 SYT17Q9BSW7 474 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 TTYH3Q9C0H2 523 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 LRMDAQ9H2I8 198 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ELFN1P0C7U0 828 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 FAM151BQ6UXP7 276 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 VMP1Q96GC9 406 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CDH19Q9H159 772 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 BTRCQ9Y297 605 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 E9PAM4 449 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 C1RP00736 705 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 FYNP06241 537 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 HADHBP55084 474 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ABRQ12979 859 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 NPY5RQ15761 445 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CHPFQ8IZ52 775 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 RGL4Q8IZJ4 473 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 FZD8Q9H461 694 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 COQ4Q9Y3A0 265 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 KRT75O95678 551 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 UQCRBP14927 111 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 TACR2P21452 398 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 EPHA3P29320 983 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CLCNKBP51801 687 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 DNAJB14Q8TBM8 379 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CPT1BQ92523 772 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 DYTNA2CJ06 578 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 TSPAN8P19075 237 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CRHR1P34998 444 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 TCEA2Q15560 299 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.143e-7■■□□□ 14.2
SH3BP4-203ENST00000409212 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ATRNL1Q5VV63 1379 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 AP2A1O95782 977 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 NUDT14O95848 222 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 PKMP14618 531 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 PRKAG1P54619 331 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 GPR158Q5T848 1215 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CDC73Q6P1J9 531 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 NELL1Q92832 810 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ANGPT4Q9Y264 503 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 GPSM3Q9Y4H4 160 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 PTGES3LE9PB15 166 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 GSSP48637 474 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 NEDD8Q15843 81 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CEP78Q5JTW2 689 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CERS6Q6ZMG9 384 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 FBXW8Q8N3Y1 598 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 GBA3Q9H227 469 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 PLLPQ9Y342 182 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 MYL12BO14950 172 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 WARSP23381 471 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 SPATA6LQ8N4H0 392 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 EFCAB3Q8N7B9 438 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC9A7Q96T83 725 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 RHBGQ9H310 441 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 ARHGEF4Q9NR80 690 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 TRAF6Q9Y4K3 522 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 PMM2O15305 246 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 NDUFS2O75306 463 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 COPZ1P61923 177 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-203ENST00000409212 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms