RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 OXTRP30559 389 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 MMP12P39900 470 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 CHRNA4P43681 627 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 GRIA4P48058 902 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 VPS41P49754 854 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 GPS1Q13098 491 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 GALNT3Q14435 633 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 QPCTQ16769 361 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 TTC7BQ86TV6 843 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 PRSS33Q8NF86 280 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 SGK2Q9HBY8 427 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 GGT7Q9UJ14 662 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 INVSQ9Y283 1065 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 A0A0J9YYE9 177 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 RAD51CO43502 376 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 SUN1O94901 812 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 AGTP01019 485 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 TRBC1P01850 177 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 BCKDHBP21953 392 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 CCDC15Q0P6D6 951 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 TCF15Q12870 199 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 RALGDSQ12967 914 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 SPARCL1Q14515 664 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 KCNJ11Q14654 390 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 PTPRRQ15256 657 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 PPP1R7Q15435 360 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 SLC1A5Q15758 541 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 DENND5AQ6IQ26 1287 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 MNS1Q8NEH6 495 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 GAB3Q8WWW8 586 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 SCRN2Q96FV2 425 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 TRIM51Q9BSJ1 452 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 FICDQ9BVA6 458 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 FANCMQ8IYD8 2048 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 MUC6Q6W4X9 2439 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 CTAGE15A4D2H0 777 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 CAPN8A6NHC0 703 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 HRO43593 1189 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 USP12O75317 370 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 SEMA4FO95754 770 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 ALPIP09923 528 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 CTAGE8P0CG41 777 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 HLA-DPA1P20036 260 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 CTAGE6Q86UF2 777 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 CTAGE4Q8IX94 777 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 CPT1BQ92523 772 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 IFT43Q96FT9 208 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 SPACA7Q96KW9 195 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 LYSMD1Q96S90 227 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 CARD6Q9BX69 1037 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 FSD1LQ9BXM9 530 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 PREBQ9HCU5 417 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 B4GALT6Q9UBX8 382 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 FAM187AA6NFU0 413 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 PSMD3O43242 534 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 APRTP07741 180 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 CTPS1P17812 591 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 TPSB2P20231 275 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 LHCGRP22888 699 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 BASP1P80723 227 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 TPSAB1Q15661 275 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 CDKN3Q16667 212 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 TMEM52BQ4KMG9 183 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 USP45Q70EL2 814 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 DPPA4Q7L190 304 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 CEP112Q8N8E3 955 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 PRRX2Q99811 253 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-210ENST00000477812 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.03■□□□□ 0.8
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