RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 HASPINQ8TF76 798 aa15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 BCO2Q9BYV7 579 aa15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TBC1D13Q9NVG8 400 aa15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 MYO1GB0I1T2 1018 aa15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PSMB9P28065 219 aa15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TRPC1P48995 793 aa15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PIGFQ07326 219 aa15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ZBED5Q49AG3 693 aa15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TIGD2Q4W5G0 525 aa15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SNX29P2Q8IUI4 249 aa15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ANKRD52Q8NB46 1076 aa15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 HDAC10Q969S8 669 aa15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 RAD21L1Q9H4I0 556 aa15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 WDR70Q9NW82 654 aa15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.39■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 LTBP1Q14766 1721 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ATG7O95352 703 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 GLDCP23378 1020 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SERPINB1P30740 379 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PMS2P3Q13401 168 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TAMM41Q96BW9 452 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PCYT2Q99447 389 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 C17orf80Q9BSJ5 609 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PDGFCQ9NRA1 345 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 EXD2Q9NVH0 621 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ATE1O95260 518 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 HADHAP40939 763 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 NPY2RP49146 381 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 LINC00523Q86TU6 105 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 MICU2Q8IYU8 434 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ESAMQ96AP7 390 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 NSMCE2Q96MF7 247 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 IGSF9Q9P2J2 1179 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 BAG5Q9UL15 447 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 FAM50BQ9Y247 325 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 CNTNAP1P78357 1384 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TCAF2A6NFQ2 919 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 LSM1O15116 133 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 IREB2P48200 963 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 GTF2H3Q13889 308 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 RAB39AQ14964 217 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 CYP2A13Q16696 494 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 GPR158Q5T848 1215 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 HTRA1Q92743 480 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 WNT8BQ93098 351 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PALMDQ9NP74 551 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ATAD3AQ9NVI7 634 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SEPT3Q9UH03 358 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 CPA4Q9UI42 421 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ANAPC2Q9UJX6 822 aa15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SDHDO14521 159 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 DPEP1P16444 411 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 IL5RAQ01344 420 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PLD3Q8IV08 490 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 FAM110BQ8TC76 370 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 CAPSLQ8WWF8 208 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 NT5MQ9NPB1 228 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 MAGEB16A2A368 324 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 C16orf96A6NNT2 1141 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 FAM72CH0Y354 149 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ELK4P28324 431 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PAGE2BQ5JRK9 111 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 FAM72AQ5TYM5 149 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 FAM72DQ6L9T8 149 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 PRR23BQ6ZRT6 265 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 HFE2Q6ZVN8 426 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 FAM72BQ86X60 149 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 FAR2Q96K12 515 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 ABCB10Q9NRK6 738 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 FAIMQ9NVQ4 179 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 HS6ST1O60243 411 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 SNX2O60749 519 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 CHRNB3Q05901 458 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 RABL3Q5HYI8 236 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 MILR1Q7Z6M3 343 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 HIPK3Q9H422 1215 aa15.37■□□□□ 0.05
USP25-201ENST00000285679 EPB41L1Q9H4G0 881 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms