RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171404.7

Gtf3c4-204, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c4, Length 7,127 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 PigxQ99LV7 254 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 CpqQ9WVJ3 470 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Usp17ldG5E8G2 545 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Usp17lcG5E8I7 545 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gtpbp1O08582 668 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Clk3O35492 638 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mmtag2Q99LX5 260 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 RereQ80TZ9 1558 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Clca3bE9PUL3 1044 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Ercc2O08811 760 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 NfiaQ02780 532 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Larp7Q05CL8 570 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Vps51Q3UVL4 782 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Klhdc10Q6PAR0 439 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Pwp2Q8BU03 919 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Myl9Q9CQ19 172 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Marc1Q9CW42 340 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Med20Q9R0X0 212 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 TroapB7ZNG4 668 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Glb1P23780 647 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Tmem165P52875 323 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Usp46P62069 366 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Ppp3caP63328 521 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Zyg11bQ3UFS0 744 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Pcdh8Q7TSK3 1070 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Samd4bQ80XS6 687 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 TagapB2RWW0 714 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Prkag1O54950 330 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rxfp1Q6R6I7 758 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Svs1Q6WIZ7 820 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Kxd1Q80XH1 177 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Btnl9Q8BJE2 536 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Arhgap28Q8BN58 729 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 TheglQ9DA15 459 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 HephQ9Z0Z4 1157 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Prl6a1O35257 230 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 H2afxP27661 143 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 LcorlQ3U285 600 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 OmpQ64288 163 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Tas2r104Q7M723 302 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Oscp1Q8BHW2 379 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Snrpb2Q9CQI7 225 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hmox2O70252 315 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 OstnP61364 130 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Prdx5P99029 210 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Frmd5Q6P5H6 517 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Tmem214Q8BM55 687 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gpr180Q8BPS4 441 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rbm34Q8C5L7 375 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Wnt9aQ8R5M2 365 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Slc26a5Q99NH7 744 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hmg20aQ9DC33 346 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gm8906L7N2A2 181 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Cdh9P70407 786 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mapkapk3Q3UMW7 384 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gstt2Q61133 244 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Slc20a1Q61609 681 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Klra3Q64329 266 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Olfr855Q7TRF8 312 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Tecpr1Q80VP0 1166 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Prkaa2Q8BRK8 552 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mamdc2Q8CG85 686 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Acsm2Q8K0L3 575 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mrpl45Q9D0Q7 306 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Snx29Q9D3S3 818 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Fads2Q9Z0R9 444 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rpl9-ps6A0A140T8T4 192 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Sult2a7A0A1B0GRF0 313 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gm340F6RGI3 1242 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Tulp2P46686 562 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mxd1P50538 227 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rpl9P51410 192 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 NadkP58058 439 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Slc17a7Q3TXX4 560 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Bcl2a1bQ497M6 172 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 N4bp1Q6A037 893 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Znf821Q6PD05 413 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 FignQ9ERZ6 759 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Smok3aC0HKC8 504 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Smok3bC0HKC9 504 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 4930544D05RikJ3QK56 214 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Map2k3O09110 347 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 PargO88622 969 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Fam129aQ3UW53 926 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Nr1h2Q60644 446 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Slc26a2Q62273 739 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Prmt6Q6NZB1 378 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Ints6lQ8BND4 861 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Ldhal6bQ8BVP2 382 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Dis3lQ8C0S1 1053 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Slc3a1Q91WV7 685 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 IgtpQ9DCE9 423 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Wnt8bQ9WUD6 350 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rpl9-ps1S4R1R7 191 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 DnmbpQ6TXD4 1580 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gm5478D3Z6R0 159 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Cdh16O88338 830 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Prdx3P20108 257 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Slc16a10Q3U9N9 512 aa15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mpzl3Q3V3F6 237 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.6 ms